摘要: 噬菌体在维持宿主肠道微环境中发挥着重要作用.基于宏基因组学方法全面研究阿旺绵羊肠道噬菌体.共注释到1 050种噬菌体，主要来自10个门、11个科、225个属和1 050个种.大多数噬菌体主要来自长尾病毒科Siphoviridae、短尾噬菌体科Podoviridae和肌尾噬菌体科Myoviridae，所占比例分别为29.9%、12.8%和9.1%.其中未分类到科的噬菌体占34.4%. 225个属主要为塞昆克病毒属Cequinquevirus(2.8%)、痘苗病毒属Vaccinivirus(2.8%)、副痘病毒属Parapoxvirus(1.8%)和弗鲁纳病毒属Friunavirus(1.1%)等.在种水平上，1050个噬菌体注释到的种包括有尾噬菌体Caudovirales＿phage(9.4%)、克拉斯噬菌体CrAss＿phage(3.4%)和蛭弧菌噬菌体Bdellovibrio＿phage(1.3%)等.此外，不同养殖方式之间，噬菌体群落结构存在显著差异（科水平：R=0.853,P <0.01；属水平：R=0.832,P <0.01；种水平：R=0.840,P <0.01）.在α多样性指数方面，不同养殖方式的Chao1指数与Shannon指数存在着显著差异.本研究揭示了阿旺绵羊肠道噬菌体的群落结构特征以及养殖方式对肠道噬菌体群落结构的重要影响，为利用肠道噬菌体进行疾病防控提供了新的视角，也为保障阿旺绵羊肠道健康提供了重要的理论依据.（图17表1参24）

摘要: 工农业迅速发展引起的氮沉降极大影响了土壤微生物，土壤原生生物是土壤微生物类群的重要组分，氮沉降对其影响尚不明确.以贝加尔针茅草原为研究对象，设置8个氮素梯度（0、15、30、50、100、150、200和300 kg hm-2 a-1，以N计），基于13年长期氮沉降试验，解析长期氮沉降条件下草甸草原土壤原生生物群落结构及多样性变化，并结合土壤理化因子探究影响其变化的主要因素.结果表明：丝足虫门（Cercozoa）、纤毛虫门（Ciliophora）、顶复门（Apicomplexa）、锥足亚门（Conosa）和绿藻门（Chlorophyta）是贝加尔针茅草原土壤原生生物的优势门（平均相对丰度> 1%）.内黏菌亚门（Endomyxa）、顶复门（Apicomplexa）和绿藻门（Chlorophyta）的相对丰度在不同氮沉降梯度具有显著差异（P <0.05）.长期氮沉降条件下，中低氮素添加（N15-N100）可以提高原生生物群落α多样性，但中高氮素添加处理（N100-N300）显著影响土壤原生生物群落结构（P <0.05）.随着施氮量的增加，土壤原生生物群落和功能组成的相对丰度存在明显的差异，其中吞噬型原生生物相对丰度呈上升趋势，寄生型原生生物的相对丰度则呈下降趋势.此外，土壤pH和土壤无机氮是影响土壤原生生物群落组成和多样性变化的重要土壤理化因子.综上所述，长期氮沉降明显影响了贝加尔针茅草原土壤原生生物群落多样性、结构和功能组成，且通过改变土壤理化环境间接影响了土壤原生生物群落组成；研究结果丰富了关于氮沉降影响贝加尔针茅草原土壤微生物的认识.（图7表3参44）

摘要: 土壤胞外酶是来自土壤微生物、植物和动物的生物活性物质，影响草地生态系统的物质循环和能量流动，在环境条件变化时可降解土壤中复杂有机质.酶活性（EEA）及其化学计量比是衡量土壤微生物养分限制的关键指标.测定川西北高寒退化草地5个恢复年限（未恢复、恢复2年、恢复6年、恢复12年、未退化）和2个不同土层（0-10和10-20 cm）的C-获取酶（β-1,4-葡萄糖苷酶，BG）、N-获取酶（β-1,4-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶，NAG;L-亮氨酸氨基肽酶，LAP）和P-获取酶（碱性磷酸酶，AP）活性，分析其酶活变化及关键影响因子.结果表明：在恢复过程中，未退化样地的0-10和10-20 cm土层pH显著小于其他恢复年限，土壤总碳（TC）、总氮（TN）、微生物生物量碳氮磷（MBC、MBN、MBP）、BG、NAG、LAP和AP等含量均随恢复过程显著增加，土壤EEA_C:P和EEA_N:P呈增加趋势. 0-10和10-20 cm中向量长度（VL）逐渐降低，反映出恢复过程土壤微生物受碳限制程度逐渐缓解；向量角度（VA）均大于45°，表明其始终受磷限制.冗余结果表明，土壤MBC、TC、DOC是驱动土壤酶活性及化学计量变化的主要影响因子.综上所述，川西北高寒退化草地恢复过程中，随着恢复年限增加，群落多样性、土壤碳氮磷含量以及酶活性显著改善，且土壤微生物活动主要受到磷养分的限制.（图5表3参64）

摘要: 为探究人参属药用植物金平人参（Panax vietnamensis Ha et Grushv.）种子的休眠类型和激素促进其种子萌发的机理，为种苗高效生产提供理论依据，以自然成熟的金平人参种子为材料，进行不同浓度赤霉素GA₃（50、250、500 mg/L）和乙烯利（ET）(50、250、500mg/L)处理，测定不同处理组种子后熟过程的胚率、萌发率及内源激素含量.结果表明，金平人参果实成熟时种胚尚未分化完全，需经过135 d左右才能完成后熟休眠过程.在金平人参种子自然后熟过程中，赤霉素（gibberellins 3,GA₃）、反式玉米素（trans-zeatin,tZ）、二氢茉莉酸（dihydrojasmonic acid,H2JA）和乙烯利（ethylene,ET）的含量随后熟时间延长而增加，而脱落酸（abscisic acid,ABA）、吲哚-3-乙酸（3-indoleacetic acid,IAA）和水杨酸（salicylic acid,SA）的含量则逐渐降低.500 mg/L GA₃处理后，种子内源GA₃含量显著提高，ABA含量降低；IAA、ET含量随后熟时间延长逐渐升高，H2JA逐渐降低.500 mg/L GA₃处理可缩短金平人参种子后熟时间，并显著促进种子萌发.乙烯利（ET）处理后，种子内源激素含量无显著性差异，且种子后熟时间和种子萌发率未发生明显变化.本研究表明金平人参种子收获时种胚未发育完全，休眠期大约135 d，属于形态休眠类型；500 mg/L GA₃可有效缩短种子的后熟休眠时间、促进萌发；ET处理对金平人参种子的萌发及休眠解除无促进作用.（图8表1参50）

摘要: 为探明三峡库区沉积物污染特征和沉积物与上覆水界面氮磷释放规律，以库尾笋溪河沉积物为研究对象，对其污染现状进行分析和评价，并通过室内模拟试验，考察上覆水环境因子（扰动、pH、温度）对笋溪河沉积物氮磷释放的影响.结果表明：（1）沉积物总氮（STN）和总磷含量均值分别为430和200 mg/kg，有机质（SOM）含量的最小值、最大值和平均值分别为0.73、46.31、10.04 g/kg;STN含量与SOM呈极显著正相关（P <0.01）.(2)单因子指数评价表明，河道中个别样点沉积物氮的污染指数已达到重度污染水平，沉积物磷的污染指数在0.18-0.80之间，属于清洁—轻度污染等级；整体而言，存在污染的样点占总样点数的26.5%.(3)室内模拟试验发现：上覆水总氮浓度在温度为35℃时显著高于5℃和25℃（P <0.05）；上覆水总磷浓度在100 r/min的扰动水平下显著低于200 r/min(P <0.05)；而硝态氮在酸性（pH=5）和碱性（pH=9）环境中的释放量则显著高于中性（pH=7）环境.总之，上覆水环境因子显著影响了沉积物氮磷释放，沉积物氮磷营养盐释放潜力为评估上覆水体的释放风险提供了重要信息；以上研究结果可为笋溪河水体富营养化防治提供参考.（图5表7参42）

摘要: 随着社会的不断发展，餐厨垃圾的产量逐年增加.餐厨垃圾成分复杂、含水率高并且富含有机物，焚烧、填埋等传统餐厨垃圾处理方法在节能环保方面仍存在一定的局限性.炭化技术是一种能耗低、处理速度快、产物价值高的热化学处理技术，能够实现餐厨垃圾的稳定化、减量化和资源化，所得的碳材料具有广阔的应用前景.首先综述当前常见餐厨原料制备生物炭的研究进展，总结餐厨基生物炭的理化特性.餐厨基生物炭具有炭化程度高、孔隙结构发达、表面含氮官能团丰富的优点.其次详细讨论餐厨基生物炭对生物发酵的促进效果和影响机制.餐厨基生物炭能够通过减弱氨氮等抑制因子的影响、促进微生物直接种间电子传递等机制来改善厌氧发酵系统的性能，也能通过改善堆体理化性质、减少碳氮营养元素的流失、增加微生物多样性等机制来提高堆肥的腐殖化程度.未来应重点关注餐厨基生物炭的生产工艺改进及强化生物发酵的中试和大规模试验，并借助生态足迹、生命周期评价等手段对添加生物炭所带来的经济效益及环境影响进行评估，为餐厨基生物炭在生物发酵领域的工业化应用提供参考.（图3表5参78）

摘要: 为探究马尾松幼苗与菌根真菌互作利用难溶性磷酸盐的策略，采用接种外生菌根真菌和难溶性磷酸盐供应双因素随机试验，设置接种橙黄硬皮马勃（Scleroderma citrinum,Sc）和不接菌两种处理，同时设置P0、P50、P100、P200和P500共5个难溶性磷酸盐供应水平，研究接种Sc与不接菌的马尾松幼苗在不同难溶性磷酸盐供应水平下生长与生理特性的差异.结果表明：（1）随难溶性磷酸盐供应水平的增加，马尾松幼苗的苗高、地径、根干重及总生物量增加，均在P200达到最大水平；在低水平难溶性磷酸盐（P0、P50）供应下，接种Sc后马尾松幼苗的苗高分别提高了20.80%、11.71%，地径分别提高了16.49%、13.43%(P <0.05).(2)马尾松幼苗O2-、H2O2、SOD、POD和CAT活性随难溶性磷酸盐供应水平的增加而显著降低；在低水平难溶性磷酸盐供应下，接种Sc降低了马尾松幼苗MDA及Pro含量.本研究表明一定浓度的难溶性磷酸盐添加可以促进马尾松幼苗的生长；同时，接种橙黄硬皮马勃减轻了低水平难溶性磷酸盐供应对马尾松幼苗的氧化损伤，促进了马尾松幼苗苗高与地径生长.（图4表1参42）

摘要: 【目的】本研究旨在为深入开展西方蜜蜂Apis mellifera caspase-3基因（Am-caspase-3）的功能研究提供参考和依据。【方法】通过PCR扩增Am-caspase-3的编码序列（Coding sequences,CDS）后进行Sanger测序验证，并利用生物信息学工具预测Am-caspase-3蛋白的理化性质、分子特征及蛋白互作网络。利用MEGA软件进行西方蜜蜂和其他物种caspase-3系统进化分析。采用RT-qPCR检测Am-caspase-3在不同组织和发育阶段，工蜂成虫应答东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae侵染过程以及工蜂幼虫应答蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis侵染过程中的相对表达量。【结果】Am-caspase-3的CDS长度为1 023 bp，编码340个氨基酸。Am-caspase-3的分子式为C₁₇₆₀H₂₇₀₃N₄₅₉O₅₃₉S₂₃，相对分子量为39 kD，不含跨膜结构域和信号肽区，但包含44个磷酸化位点，主要分布于细胞质。Am-caspase-3的二级结构包括184条无规则卷曲，90个α-螺旋，46条延伸链和20个β-转角。在Am-caspase-3中鉴定到1个结构域和3个保守基序；Am-caspase-3与其模版1m72.1.A之间的同源性达73.00%。Am-caspase-3与CytC等12个蛋白构成1个互作网络。西方蜜蜂与东方蜜蜂Apis cerana的caspase-3之间同源性达81.23%，在进化树上聚为一支。Am-caspase-3在西方蜜蜂工蜂不同组织中差异表达，在中肠中的表达量最高且极显著高于其他6个组织（P<0.01）。Am-caspase-3在3日龄幼虫中的表达量达峰值且极显著高于卵、7-8日龄预蛹及12日龄蛹（P<0.01）。Am-caspase-3在2、6、15和18日龄成虫体内的表达量显著高于1日龄成虫体内的表达量（P<0.05）。Am-caspase-3在工蜂成虫应答东方蜜蜂微孢子虫侵染的1、4、7、10和13 d皆显著下调（P<0.05）,Am-caspase-3在工蜂幼虫应答蜜蜂球囊菌侵染的1、2和3 d均显著上调（P<0.05）。【结论】成功克隆到Am-caspase-3的CDS;Am-caspase-3是潜在的酸性蛋白、亲水性蛋白和胞内蛋白，与CytC等11个蛋白之间存在互作关系；西方蜜蜂与东方蜜蜂的caspase-3之间同源性最高；Am-caspase-3潜在参与西方蜜蜂工蜂不同组织和虫态的发育过程及宿主应答病原真菌侵染的过程。

摘要: 【目的】家蚕Bombyx mori是重要的资源昆虫，其主产品蚕丝具有极高的生物学价值与经济价值。目前，与家蚕产丝调控相关的基因研究较少。为丰富家蚕产丝相关基因的基础数据，深入挖掘家蚕产丝机制，本研究开展了家蚕产丝相关基因的生物信息学分析。【方法】本研究整合了前期对15个蚕丝产量相关的改良相关基因的注释，采用转录组分析方法筛选出显著差异表达的家蚕产丝相关基因，对其进行了染色体定位分析、理化性质分析及亚细胞定位分析、富集分析；并针对关键家蚕产丝相关基因agtpbp1与lov进行了60个鳞翅目物种范围的种间基因家族鉴定与进化分析。【结果】结果表明，蚕丝产量相关的改良基因NDRG3、PDSS1、beta-Spec、KNCK1、unc-22、BR3、ZMYND8、XNP＿1、Bin1、lov在家蚕蛹前期与5龄幼虫的前丝腺部位具有显著表达差异，P值分别为4.523 2×10^-6、1.586 6×10^-4、5.261 5×10^-7、6.210 8×10^-3、8.113 4×10^-10、2.014 5×10^-19、4.858 2×10^-2、7.767 6×10^-23、3.361 3×10^-17、3.896 7×10^-4；蚕丝产量相关的改良基因beta-Spec、XNP＿2、KNCK1、agtpbp1、BR3、XNP＿1、Bin1、dpyd、lov在家蚕蛹前期与5龄幼虫的中丝腺部位具有显著表达差异，P值分别为9.518 4×10^-8、1.984 3×10^-3、4.451 3×10^-3、1.536 7×10^-2、3.185 9×10^-8、1.111 6×10^-9、6.770 7×10^-30、9.297 5×10^-3、4.735 3×10^-2；蚕丝产量相关的改良基因NDRG3、beta-Spec、XNP＿2、KNCK1、agtpbp1、unc-22、BR3、lov在家蚕蛹前期与5龄幼虫的后丝腺部位具有显著表达差异，P值分别为8.433 2×10^-3、1.372 5×10^-46、1.059 8×10^-10、6.215 6×10^-5、1.235 0×10^-11、2.491 7×10^-3、8.664 0×10^-25、9.349 1×10^-4。这些基因在转录、转录后修饰、翻译及翻译后修饰等多个层面直接或间接影响蚕丝蛋白的合成与储存。分析显示，agtpbp1和lov种间基因家族分别具有34和37个基因，且两个家族分别有26和1个正选择基因，agtpbp1家族的Bbet001799等8个基因存在正选择位点。【结论】本研究分析了15个蚕丝产量相关的改良相关基因，鉴定了agtpbp1和lov两个关键基因的种间基因家族，完成了其进化分析。

摘要: 【目的】明确不同豇豆品种蓟马的危害程度及挥发物组分差异，挖掘用于显著调控蓟马活动的行为调节剂，以期为蓟马的生态调控策略提供科学依据。【方法】利用固相微萃取-气质联用技术（SPME-GC-MS）测定4个豇豆品种(大麻、肉麻、天瑞^（2）和长麻)的挥发物组成，结合化合物含量进行种类分析，同时，采用5点实地调查法分析了不同品种间蓟马的危害程度。【结果】4个品种中肉麻受蓟马的危害程度最低，大麻受危害程度最高，危害长麻的蓟马种类最多，且均以豆大蓟马Megalurothrips usitatus危害最为严重，其次为花蓟马Frankliniella intonsa。4个品种豇豆叶片(大麻14种、肉麻17种、天瑞^（2）16种、长麻13种)和花(大麻11种、肉麻10种、天瑞^（2）12种、长麻17种)挥发物共检测到23种，叶片和花挥发物中各有8个化合物为4个品种共有。苯甲醛和β-紫罗兰酮在大麻、肉麻和长麻叶片中含量较高也较为稳定，显著高于天瑞^（2）中的含量（P<0.0001）。在4个品种叶片挥发物中脂肪酸衍生物含量最高，其次为苯环类化合物；但在大麻、肉麻和天瑞^（2）花挥发物中，脂肪酸衍生物含量最高，其次为萜烯类化合物，而在长麻花挥发物中萜烯类化合物含量最高。【结论】4个品种叶片和花挥发物种类和含量上均有差异，通过对共有挥发物中主要化合物（苯甲醛和β-紫罗兰酮为叶片共有，芳樟醇和棕榈酸甲酯为花共有）以及独有特征性化合物(乙酸叶醇酯为天瑞^（2）叶片特有、十六醛为大麻叶片特有、1-辛烯-3-醇为大麻花特有、苯乙酮为长麻花特有、十八醛为肉麻花特有、植酮为天瑞花^（2）特有)的分析对比，并结合危害程度及现有文献推测苯甲醛、芳樟醇、乙酸叶醇酯、β-紫罗兰酮、1-辛烯-3-醇、苯乙酮、苯丙醇、肉桂醛、氨茴酸甲酯和水杨酸甲酯可作为开发蓟马行为调控剂的重要化合物。