摘要: 为探讨阿勒泰(鱥)Phoxinus phoxinus ujmonensis种质资源现状及遗传多样性水平,利用线粒体CO Ⅰ基因序列对阿尔泰山保护地4个不同群体进行遗传多样性分析.结果显示:116尾阿勒泰(鱥)样本CO Ⅰ基因序列的A+T平均含量(54.02％)＞C+G平均含量(45.98％);共定义了13个单倍型,整体单倍型多样性为0.454±0.053,核苷酸多样性为0.000 84±0.000 12;群体间遗传距离为0.000 33～0.001 28,群体内遗传距离为0.000 11～0.001 43;单倍型系统发育树并未呈现明显的地理遗传结构;单倍型网络结构图呈单一星状分布态势;群体间遗传分化指数为-0.01134～0.133 33;中性检验(Tajima's D=-2.005 80,Fu's Fs=-13.198)与核苷酸错配分布均表明,阿勒泰(鱥)群体在历史上经历过种群扩张事件;分子方差分析结果显示遗传变异主要源于群体内(94.11％).研究表明,阿尔泰山保护地4个阿勒泰(鱥)群体遗传多样性偏低,其中苏木达依叶克河群体遗传多样性最低,且呈现高单倍型多样性和低核苷酸多样性的遗传特征.本研究结果认为,阿尔泰山保护地阿勒泰(鱥)种群存在不稳定风险,应进一步加强种质资源保护和合理的渔业资源利用.

摘要: 为探究华南沿海地区5个大刺鳅Mastacembelus armatus种群的群体遗传多样性和遗传结构,测定分析了155个样本的线粒体cytb基因.结果显示,cyt b基因序列长1 138 bp,包含48个变异位点和28个单倍型,单倍型多样性为0.772 00,核苷酸多样性为0.005 90.AMOVA分析显示,其遗传变异主要来源于群体内(62.85％).系统发育分析显示,所有群体聚成2支:支系Ⅰ包括南流江和红河水系的全部样本,以及郁江、南渡江和鉴江的部分样本;支系Ⅱ则主要由南渡江、郁江和鉴江的另一部分样本组成.由单倍型网络关系图可知,南渡江、郁江、南流江和鉴江种群共享单倍型H5的个体数量最多,推测H5可能是该地区最古老的单倍型,其他单倍型可能由其逐步进化而来.种群核苷酸错配分析和中性检验结果表明,除红河和南流江种群外,其他种群近期未发生过种群扩张事件.本研究结果为华南沿海地区大刺鳅种质资源的保护和合理开发利用提供了参考资料.

摘要: 为探讨环境因子对藏仓鼠Cricetulus kamensis种群遗传多样性的影响,基于4个线粒体串联序列计算了藏仓鼠不同地理种群的遗传多样性,并通过冗余分析和多元线性回归分析其种群遗传多样性与环境因子的关系.结果表明:藏仓鼠种群单倍型多样性较高而遗传多样性较低;藏南种群表现出较高的遗传多样性,其中定日种群遗传多样性最高(π=0.016);冗余分析和多元线性回归结果表明,地理和环境因子对藏仓鼠种群遗传多样性的影响不显著;位点模型在3个线粒体蛋白编码基因中未检测到正选择信号,表明环境压力对遗传变异的选择作用较小;空间自相关分析表明,成对遗传距离与地理距离之间存在显著正相关性(P＜0.01),地理障碍导致的基因流动受限而呈现出距离隔离效应.综上所述,环境因子对适应了高原环境的藏仓鼠种群遗传多样性表现出较小的影响,而地理屏障对种群间的基因交流影响较大.

摘要: 2023-2024年在大熊猫国家公园四川千佛山片区96个调查网格中收集到大熊猫Ailuropoda melanoleuca新鲜粪便34份,基于8个微卫星位点和线粒体D-loop区建立个体遗传档案.基于微卫星数据,结合线粒体D-loop序列在片区内鉴定到10只大熊猫.为进一步优化基于粪便DNA的大熊猫性别鉴定方法,本研究基于X染色体釉原蛋白基因开发了1对新的性别鉴定引物(SEX),该引物成功鉴定出10只个体的性别,即5雄5雌,该引物对粪便DNA扩增稳定、效果好,能有效用于野生大熊猫种群性比分析.在识别到的个体中共鉴定到线粒体D-loop序列3个单倍型,8个多态性位点,单倍型多样性为0.211,核苷酸多样性为0.002 11;8个微卫星位点的期望杂合度为0～0.901,观测杂合度为0～0.889,有7个位点极显著偏离哈迪-温伯格平衡(P＜0.01),表现为杂合不足;种群平均近交系数为0.571.研究表明,本区域大熊猫遗传多样性处于中等偏低水平,性比为1∶1,近交情况较严重,有遗传丢失的风险,应加强保护.

摘要: 为了探究秦岭大熊猫（Ailuropoda melanoleuca qinlingensis）圈养种群的遗传多样性和亲子关系，指导其科学繁育，本研究建立了一套优化的技术体系。利用筛选出的9个高分辨率微卫星位点（以四碱基重复为主）进行PCR扩增与毛细管电泳分型，并对32只个体进行遗传多样性分析。结果显示：通过均质化与热孵育预处理，显著提升了粪便样本中宿主基因组DNA的得率与质量。秦岭大熊猫群体H_o为0.281～0.938，平均为0.596,H_e为0.391～0.793，平均为0.560, H_o> H_e，说明基因杂合度水平高；多态信息含量（PIC）为0.351～0.747，平均为0.499，其中3个位点为高度多态性，其余为中度多态性，群体遗传多样性高。亲子关系鉴定结果显示，利用9对微卫星引物组合在双亲未知时单亲累积排除概率（CE-1P）达0.999 999，双亲之一已知时单亲累积排除概率（CE-2P）达0.999 978，双亲未知时亲本对累积排除概率（CE-PP）达0.999 088。基于上述方法及Pop Gen32与i TOL的遗传距离聚类分析，成功明确了5只子代的父本来源。研究结果为完善大熊猫遗传谱系、防止近交衰退及制定科学配种方案提供了可靠的技术支持和关键数据。