摘要: 研究基于线粒体Cyt b基因,对中华沙塘鳢和河川沙塘鳢进行群体遗传学研究,并利用传统形态学参数与框架结构数据相结合的方法探究二者间的形态差异。遗传多样性分析结果表明,采自永州、咸宁及潜江共计3个地点128尾中华沙塘鳢共检测到21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.868和0.00407;采自湖州、宣城、南京及安庆共计4个地点195尾河川沙塘鳢共检测到28个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.910和0.02000。基于BI法和ML法构建的单倍型分子系统发育树结果显示,所有沙塘鳢属鱼类聚为1个单系,两物种也各自构成1个单系,且得到较强的支持。中华沙塘鳢识别出2个谱系,河川沙塘鳢识别出3个谱系,二者均呈现明显的地理格局分布。AMOVA结果显示中华沙塘鳢各地理群体间的遗传分化指数为0.463—0.845;河川沙塘鳢各地理群体间的遗传分化指数为0.653—0.930,种群间表现为高度的遗传分化,群体间均存在广泛的地理隔离。中性检验和错配分析表明,中华沙塘鳢咸宁（XN）种群经历过近期的扩张,时间为0.20 Ma,其余群体历史动态分析各方法的结果稍有差异,显示种群历史相对复杂。综合形态分析结果,中华沙塘鳢和河川沙塘鳢存在明显形态差异。主成分分析结果显示二者间仅少量个体有重叠,绝大部分个体能较好分开。判别分析获得综合判别准确率为95.7%,判别效果极显著（P<0.01）,研究建立的判别公式可以进行两种鱼类的简单判别。通过主成分分析和判别分析识别出对种间差异最具贡献的8个形态特征变量,分别是眼后头长、第一背鳍长、第一背鳍基长、胸鳍长、BH、BI、CD、CG,大多与鳍条和躯干部的特征相关。本研究中,形态分化(Q_ST)与遗传分化(F_ST)之间没有显著相关性,但统计分析表明两种沙塘鳢属鱼类种间以及种群间的遗传分化程度显著大于其形态分化程度,表明表型在不同的群体中受到偏向的选择。

摘要: 为探究北方地区拉氏大吻鱥（Rhynchocypris lagowskii）群体的遗传多样性,研究利用基因分型技术（Genotyping-by-sequencing, GBS）,对天津宁河、天津蓟州、天津泃河和辽宁太子河4个拉氏大吻鱥群体共109尾个体进行全基因组水平的单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism, SNP）标记开发和遗传特征分析。通过测序共获得SNP标签3723530个,经过滤后共得到高质量SNP位点133536个用于遗传多样性分析。4个群体的期望杂合度（H_e）为0.0397—0.0884,观测杂合度（H_o）为0.0394—0.0818,核苷酸多样性（P_i）为0.0406—0.0908,多态信息含量（PIC）值为0.0327—0.0717,群体间的遗传分化系数(F_ST)为0.0039—0.8148,群体内近交系数(F_is)为0.0567—0.5480。遗传结构分析表明4个群体聚为3个明显的类群,天津宁河群体和天津蓟州群体的个体聚为一支,辽宁太子河群体和天津泃河群体的个体分别聚为一支。4个群体均发现了群体特异性SNP标记,可以作为拉氏大吻鱥群体鉴定、群体遗传、性状关联分析和进化分析的候选分子标记。种群历史动态研究表明, 4个群体在第四纪冰川期均经历了有效群体大小（N_e）急剧下降过程。

摘要: 研究聚集于罗非鱼的鳃寄生非洲拟车轮虫（Paratrichodina africana El-Tantawy&Kazubski, 1986）,基于附着盘形态量化与SSU rDNA分子数据对采自重庆与广东两地的罗非鱼鳃寄生非洲拟车轮虫进行了群体分化与遗传多样性研究。基于附着盘形态量化研究结果表明:重庆与广东两种群除了在齿体形态（齿体纵长、齿长、齿钩长）和齿体比方面具显著性差异（P<0.05）外,其他方面均无差异; PCA分析结果显示广东种群的散点图分布包含于重庆种群之中,表明两种群的形态相似度极高。遗传多样性研究结果:28个SSU rDNA分子序列共计检测到10个单倍型,含7个特有单倍型和3个共享单倍型,其中Hap 3是最大的共享单倍型,且重庆、广东两地均有分布;广东种群（高H_d高P_i型）的遗传多样性高于重庆种群（高H_d低P_i型）,推测水温与地理分布可能是影响非洲拟车轮虫遗传多样性的重要因素。分子系统发育分析结果显示:来自广东的Hap5位于系统树底部,且广东样本遍布于每个分支;而遗传分化指数(F_st)和基因流（N_m）结果显示两群体间的基因交流不频繁,具有中等程度的遗传分化,以此推测重庆种群起源于广东种群,且分子变异分析（AMOVA）结果进一步证明其种群变异主要来源于群体内（变异率为92.18%）。中性检验（Tajima’s D和Fu’s F_s）和核苷酸错配分析结果认为,非洲拟车轮虫整个群体可能经历过早期的种群扩张,但近期未发生;而不同地理群体（广东种群与重庆种群）均未经历过种群扩张事件。研究为后续车轮虫的群体遗传及谱系地理学研究奠定基础,同时为水产养殖的车轮虫病害防控提供参考资料。

摘要: 为进一步研究的肌间刺形态分布和遗传结构,对不同群体进行肌间刺形态观察和微卫星分析。结果显示,鲂鲌三倍体(MC-3n)、鲂鲌二倍体(MC-2n)、团头鲂(MA)和翘嘴鲌(CA)的平均肌间刺数目分别为129.4、129.0、124.5和137.6根, MC-3n与MC-2n之间的肌间刺数目差异不显著(P>0.05),但两者与父母本的肌间刺数目差异显著(P<0.05),且介于父母本之间。4个群体均含有7种类型的肌间刺,且左右两侧肌间刺类型和数目均不相同,但差异不大。4个群体的平均等位基因数分别为4.55、4.15、4.05和3.30;平均观测杂合度分别为0.8817、0.7967、0.8250和0.5550;平均期望杂合度分别为0.6740、0.6435、0.6325和0.4941;平均多态信息含量分别为0.6081、0.5780、0.5632和0.4298,表明MC-3n和MC-2n均具有丰富的遗传多样性,且MC-3n的遗传多样性略高于MC-2n。Hardy-Weinberg平衡分析显示, 4个群体在大多数位点上都表现为杂合子过剩(D>0),仅在少数位点上表现为杂合子缺失(D<0)。MC-3n和MC-2n与其母本团头鲂的遗传相似性均高于其父本翘嘴鲌,遗传距离均低于父本翘嘴鲌,均表现出一定的母本效应。聚类分析显示, MC-3n先和MC-2n聚为一支,然后再和MA聚为一支,最后再和CA聚类,聚类结果与遗传距离一致。研究为鲂鲌杂交三倍体的育种和后续推广应用提供参考资料。

摘要: 为了厘清湖北省异育银鲫(Carassius gibelio)繁殖群体的种质资源现状,研究以湖北省6个苗种繁殖场的异育银鲫亲本为研究对象,比较不同群体的生物学特征和品质性状的差异,利用基因组重测序进行品种与克隆系鉴定和遗传多样性分析。研究结果表明,根据180尾异育银鲫全基因组重测序的SNPs,共鉴定出10个异育银鲫克隆系,其中2个异育银鲫“中科3号”亚克隆系, 5个异育银鲫“中科5号”亚克隆系和3个其他克隆系。遗传多样性分析表明,单核苷酸密度(SNP/kb)、单核苷酸多态性(p)、多态信息含量(PIC)和观测杂合度(Ho)分别为11.17、0.0050、 0.4332和0.5612。系统发育树和主成分分析结果显示,不同群体之间表现出中度到高度的遗传分化,同时也存在较为显著的交叉聚类现象,结合异育银鲫克隆系分布,表明除了梁子湖和正大群体外的繁殖亲本存在一定的种质混杂现象。不同克隆系之间的形态上存在差异,体高/体长和头长/体长可以作为初步判断异育银鲫形态的两个参考指标。异育银鲫“中科5号”和异育银鲫“中科3号”的肌肉营养成分中粗脂肪含量差异显著,而粗蛋白含量无明显差异。不同克隆系间的肌肉中17种脂肪酸含量均存在显著差异,DHA+EPA总量在不同克隆系之间也存在差异。研究不仅有利于异育银鲫种质资源的合理开发与保护,而且有助于异育银鲫新品种选育和养殖产业的可持续发展。