检索结果(检索关键词为:遗传多样性;结果共19条)
  • 袁龙宇; 吴阳刚; 钟文东; 李燕芳; 戴阳朔; 张振飞; 肖汉祥
    昆虫学报 2025年第68卷第5期 DOI:10.16380/j.kcxb.2025.05.013
    关键词: 二化螟;;线粒体基因;;COI;;COII;;COI+COII;;遗传多样性;;系统发育
    摘要: 【目的】对广东省二化螟Chilo suppressalis越冬地理种群基数监测、遗传多样性和系统发育进行调查和分析,为制定该虫有效的联防联控策略提供理论基础和参考。【方法】2017-2022年采取五点取样法对广东省各地区稻田进行二化螟采样,根据越冬代平均数量进行分级确定二化螟发生水平。利用PCR扩增广东省二化螟9个越冬地理种群线粒体基因COI和COII,利用MEGA 7和DNA Sequence Polymorphism 5.10.01软件分析二化螟越冬地理种群遗传多样性和遗传分化趋势,并构建系统发育树和单倍型网络图。【结果】2017-2022年广东省二化螟越冬地理种群基数很高,自2018年开始二化螟种群越冬虫量基本维持在7 500头/hm<sup>2</sup>,最严重地区可达18 408头/hm<sup>2</sup>。广东省二化螟9个越冬地理种群总计检测了132条COI和COII序列,COI片段长749 bp,有30个单倍型,54个位点存在多态性;COII片段长474 bp,有22个单倍型,29个多态位点。基于COI和COII序列的系统发育树显示,广东与江西二化螟地理种群聚合为一支;粤北南雄二化螟地理种群较其他地理种群相对独立,其他地理种群聚合为一支。珠三角地区、粤北地区、粤西地区、粤东地区和赣北地区二化螟地理种群单倍型多样性(H<sub>d</sub>=0.800~0.909)和核苷酸多样性(P<sub>i</sub>=0.0035~0.0102)都处于较高水平,粤西地区地理种群的遗传多样性最低。中性检验结果显示,基于COI序列,总种群Tajima’s D值为-1.043,Fu’Fs值为-5.023;基于COII序列,总种群Tajima’s D值为-1.907,Fu’Fs值为-10.468;COI+COII联合基因序列总种群Tajima’s D值为-1.313,Fu’Fs值为-31.67。基于COI和COII序列的总种群遗传分化指数F<sub>st</sub>值分别为0.144和0.102,基因流N<sub>m</sub>值分别为1.49和2.20;COI+COII联合基因序列的总种群遗传分化指数F<sub>st</sub>值为0.229,基因流N<sub>m</sub>值为0.84。【结论】广东省近年来二化螟越冬地理种群呈偏重甚至大发生趋势,且种群具有较高的单倍型多态性和遗传多样性;粤东越冬地理种群多态性较为丰富,粤西越冬地理种群多态性最低。本研究中广东省二化螟越冬种群间存在一定程度的遗传分化,有些地理种群已产生相对较大的分化,如南雄地理种群。广东省和江西省二化螟越冬地理种群具有较近的亲缘关系,除粤西地区外其他不同地理种群之间的遗传分化距离不明显,地理种群之间的遗传分化与分布之间相关性较小,种群间具有频繁的基因交流,种群未经历明显的扩张但处于稳定增长的趋势。

  • 马钰洁; 张晓清; 王一鸣; 钟圆佳; 季荣; 袁亮
    昆虫学报 2025年第68卷第1期 DOI:10.16380/j.kcxb.2025.01.010
    关键词: 黑条小车蝗;;Cytb;;遗传多样性;;谱系地理学;;基因流
    摘要: 【目的】本研究旨在揭示中国西部新疆地区黑条小车蝗Oedaleus decorus decorus不同地理种群的遗传多样性及谱系关系,为新疆迁飞蝗虫的历史迁飞规律提供分子遗传学证据。【方法】PCR扩增新疆28个黑条小车蝗地理种群线粒体Cytb上740 bp的核酸序列,基于Cytb片段序列利用DnaSP 5.10和Arlequin 3.1软件对黑条小车蝗地理种群的遗传多样性、遗传分化格局和基因流等进行分析。【结果】从新疆28个黑条小车蝗地理种群的338条Cytb片段中共检出27个单倍型,群体单倍型多样性指数(Hd)为0.8185,核苷酸多样性(π)为0.00611,暗示黑条小车蝗种群遗传多样性水平较高;基于单倍型构建的分子系统发育树及median-joining网络关系分析表明,新疆地区黑条小车蝗地理种群被明显划分为2个地理遗传谱系:天山北麓谱系(谱系Ⅰ,包括温泉、沙湾、昌吉、乌鲁木齐和哈密种群及博乐种群的1头个体)和中哈边境谱系(谱系Ⅱ,包括伊犁、塔城和阿勒泰种群及博乐种群的11头个体);AMOVA分析显示新疆黑条小车蝗不同地理种群间的遗传变异较高(71.38%),而不同地理种群内的遗传变异水平较低(28.62%); 28个地理种群间的遗传分化指数(Fst)为-0.097~0.987, 2个地理遗传谱系之间遗传分化指数(Fst)为0.805;核苷酸错配分布呈现多峰,Tajima’s D值为0.193,Fu’s Fs为-2.863,推测新疆地区黑条小车蝗未发生历史种群扩张。【结论】新疆地区黑条小车蝗具有丰富的遗传多样性和明显的系统地理分布格局;2个地理谱系间基因交流较弱,存在较大遗传分化,但2个地理谱系内各种群存在较强基因流,推测是高山、沙漠等地理隔离所致。该研究结果为重构新疆草原蝗虫历史迁飞路径及阐明当前分布格局提供分子遗传学依据。

  • 冯新颖; 王璇; 李冰艳; 曾彪; 李虎; 刘志琦; 宋凡
    昆虫学报 2025年第68卷第1期 DOI:10.16380/j.kcxb.2025.01.011
    关键词: 橘小实蝇;;线粒体基因组;;遗传多样性;;种群动态
    摘要: 【目的】基于线粒体基因组数据,明晰云南省橘小实蝇Bactrocera dorsalis种群遗传多样性和遗传结构,揭示其在云南的扩散路径,为橘小实蝇防控策略的制定和规划提供理论依据。【方法】2022年7-9月收集云南省橘小实蝇15个地理种群,使用DNBSEQ-T7平台进行线粒体基因组测序、组装与注释;基于13个蛋白质编码基因(protein-coding genes, PCGs)序列使用MEGA-X 10.0.5, DnaSP 6.12和Arlequin 3.5.2软件分析种群遗传多样性与遗传分化;基于13个PCG和COI序列使用最大似然法构建系统发育树,使用PopART4.8.4软件构建单倍型网络;通过中性检验和错配分布分析种群历史动态。【结果】共获得云南橘小实蝇15个地理种群149条线粒体全基因组,包含共1 697个变异位点,总体表现出高水平的遗传多样性(Pi=0.00783,K=87.591,Hd=0.9994);种群间遗传距离为0.00702~0.00874,遗传分化指数为-0.02345~0.05203;系统发育树和单倍型网络均未呈现出明显的种群结构;橘小实蝇云南种群历史上发生过扩张,云南西部和南部为橘小实蝇最早入侵区域,北部地区橘小实蝇入侵时间较晚。【结论】云南省橘小实蝇不同组群均呈现出高水平遗传多样性和弱遗传结构,线粒体基因组变异位点丰富且广泛分布在所有种群中,不同地理种群间没有明显分化,推测橘小实蝇由云南西部及南部向北部地区扩散。

  • 田新民; 王佳琪; 白小珍; 刘涵奇; 石兰英
    动物学杂志 2025年第60卷第2期 DOI:10.13859/j.cjz.202524154
    关键词: 小飞鼠;;mtDNA控制区;;种群遗传结构;;遗传多样性
    摘要: 小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物,受森林采伐与栖息地丧失等因素影响,其种群数量与分布在不断减少。为增强保护与管理的针对性,亟需对其种群的遗传变化,特别是遗传多样性与基因流等种群遗传信息开展进一步评价。本研究在黑龙江省南部的方正、宾县、苇河和穆棱4个重点研究区域,分别采集到20、26、15和27只小飞鼠个体的毛发样本,采用mt DNA控制区全序列(1 070 bp)评估其种群遗传多样性与遗传结构。研究发现,在88个小飞鼠控制区全序列中,共检测到155个变异位点和67个单倍型,单倍型多样性(H<sub>d</sub>)为0.992(0.945~0.986),核苷酸多样性(P<sub>i</sub>)为1.772%(1.221%~1.974%),仅单倍型H_20为宾县与苇河种群共享,只有1只个体的单倍型有52个,其稀有单倍型高达77.16%(52/67);种群之间遗传分化系数(F<sub>ST</sub>)为0.051 3~0.135 7(P<0.05),基因流(N<sub>m</sub>)为3.19~9.24;种群之间遗传分化程度与地理距离的Mantel检验呈现不显著的正相关(r=0.413,P>0.05)。结果表明,小飞鼠种群遗传多样性丰富,其中,苇河和穆棱种群最高、宾县种群次之、方正种群最低,高比例稀有单倍型提示,未来种群存在遗传多样性下降的风险;4个地理种群之间均存在显著的中等水平遗传分化,距离隔离模型不能有效地解释小飞鼠种群目前遗传格局的形成;系统进化树与单倍型网络图没有呈现出明显的系统地理格局,其种群间基因流的限制可能是近期出现的。研究结果提示,需开展栖息地修复和生态廊道构建,从而实现该物种的种群增长与扩散。

  • 胡江伟; 刘鸿; 张涛; 海萨·艾也力汗; 杨博文; 蔡林钢; 牛建功
    四川动物 2025年第44卷第4期 DOI:
    关键词: 阿尔泰山保护地;;阿勒泰鱥;;COⅠ;;遗传多样性
    摘要: 为探讨阿勒泰鱥Phoxinus phoxinus ujmonensis种质资源现状及遗传多样性水平,利用线粒体COⅠ基因序列对阿尔泰山保护地4个不同群体进行遗传多样性分析。结果显示:116尾阿勒泰鱥样本COⅠ基因序列的A+T平均含量(54.02%)>C+G平均含量(45.98%);共定义了13个单倍型,整体单倍型多样性为0.454±0.053,核苷酸多样性为0.000 84±0.000 12;群体间遗传距离为0.000 33~0.001 28,群体内遗传距离为0.000 11~0.001 43;单倍型系统发育树并未呈现明显的地理遗传结构;单倍型网络结构图呈单一星状分布态势;群体间遗传分化指数为-0.011 34~0.133 33;中性检验(Tajima's D=-2.005 80,Fu's F<sub>s</sub>=-13.198)与核苷酸错配分布均表明,阿勒泰鱥群体在历史上经历过种群扩张事件;分子方差分析结果显示遗传变异主要源于群体内(94.11%)。研究表明,阿尔泰山保护地4个阿勒泰鱥群体遗传多样性偏低,其中苏木达依叶克河群体遗传多样性最低,且呈现高单倍型多样性和低核苷酸多样性的遗传特征。本研究结果认为,阿尔泰山保护地阿勒泰鱥种群存在不稳定风险,应进一步加强种质资源保护和合理的渔业资源利用。