摘要: 为探究大蒜E素(ALE)对副溶血弧菌的抑菌活性及作用机制,通过测定最小抑菌浓度(MIC)、最小杀菌浓度(MBC)和抑菌动态生长曲线,评价ALE对副溶血弧菌的抑菌作用;基于电镜观察及胞外β-D-半乳糖苷酶、蛋白质含量测定，分析ALE对副溶血弧菌细胞结构的影响;采用结晶紫染色法检测ALE对副溶血弧菌生物被膜形成的影响;利用RNA-Seq技术分析ALE对副溶血弧菌转录水平表达的影响。结果显示, ALE对副溶血弧菌的MIC为7.8μg/mL, MBC为31.2μg/mL。与对照组相比, MIC浓度ALE组副溶血弧菌胞外β-D-半乳糖苷酶活性和蛋白质含量显著增加(P<0.05),细胞壁膜消融、内容物流失,生物被膜形成量显著减少(P<0.05)。转录组分析结果显示,与对照组相比, 1/4MIC浓度的ALE组副溶血弧菌中显著下调基因145个,主要富集在MAPK信号转导、鞭毛组装、生物膜形成等通路; ALE组副溶血弧菌中显著上调基因133个,主要富集在氨基酸代谢、降解等通路; RNA-Seq结果与RT-qPCR验证试验结果一致。研究表明, ALE对副溶血弧菌抑菌作用强,可能通过破坏细菌菌体结构,抑制其生物被膜形成,以及调控鞭毛、生物膜等基因表达,从而发挥抑菌、减毒作用。研究结果为探明ALE抑制副溶血弧菌的作用及机理奠定良好基础。

摘要: 为进一步丰富北京雨燕（Apus apus pekinensis）基因组数据，采用Illumina NovaSeq6000测序平台对其肌肉、肺脏、心脏及血液转录组进行测序。结果显示：经质控后得到32.80 Gb的clean data数据，通过Trinity组装后，运用生物信息学方法与相关数据库比对，得到15295个（71.3%）有功能注释的unigenes。使用StringTie软件对mapped reads进行拼接后与参考基因组比对，共发掘6 700个新基因。共13 869条unigenes在GO数据库中获得注释，分类到3大类45个功能；有10 451条unigenes被归纳到KOG数据库25个直系同源功能类型；有13 339条unigenes在KEGG得到6大类50小类代谢通路注释。各个组织间差异基因分析显示，肺脏基因表达量数目最多，血液和肌肉差异表达基因数目最多，达5 281个，肺脏和血液差异表达基因数目最少，仅249个，分析结果有助于进一步了解雨燕在飞行中的器官功能和代谢调控。研究结果为进一步挖掘雨燕功能基因、分析群体遗传多样性以及探究雨燕能量代谢等方面研究提供参考资料。