摘要: 【目的】利用线粒体基因组序列数据分析缘蝽科(Coreidae)亚科间的系统发育。【方法】使用高通量测序对4种缘蝽(纹须同缘蝽Homoeocerus striicornis、广腹同缘蝽H.dilatatus、宽棘缘蝽Cletus schmidti和褐莫缘蝽Molipteryx fuliginosa)进行低覆盖度全基因组测序；从获得的全基因组测序数据中重建线粒体基因组全序列；联合已经公布的缘蝽科3个亚科32个种的线粒体基因组序列(作为内群)以及蛛缘蝽科(Alydidae)中的3个种的线粒体基因组序列(作为外群),分别采用最大似然法和贝叶斯法重建缘蝽科亚科间的系统发育。【结果】纹须同缘蝽、广腹同缘蝽、宽棘缘蝽和褐莫缘蝽线粒体基因组(GenBank登录号：OR702557-OR702560)的长度分别为15 706, 15 913, 17 685和16 959 bp,新获得的这4种缘蝽线粒体基因组的基因排列方式与典型的昆虫线粒体基因组一致，没有基因重排等特殊的基因组织结构；此外，这4种缘蝽线粒体基因组的全基因组序列、蛋白质编码基因、 rRNA基因和tRNA基因序列都具有较高的A+T含量(≥70%)。最大似然法和贝叶斯法重建的缘蝽科系统发育树具有大体相同的拓扑结构；所有结果都支持缘蝽亚科(Coreinae)为单系群，缘蝽亚科与希缘蝽亚科(Hydarinae)互为姐妹群。【结论】本研究利用线粒体基因组数据重建了缘蝽科亚科间的系统发育，结果支持缘蝽亚科为单系群，缘蝽亚科与希缘蝽亚科互为姐妹群。本研究为进一步在系统发生框架内探讨缘蝽科的系统演化提供了线粒体系统发育基因组学数据。

摘要: 【目的】基于低覆盖度全基因组测序数据和转录组数据重新构建蜡蝉总科(Fulgoroidea)高阶元类群之间的系统发育关系，为理解蜡蝉总科的系统发育关系提供基因组数据。【方法】利用二代测序技术获得了蛾蜡蝉科蜡蝉Flatida sp. 1种的低覆盖度全基因组测序数据，结合下载的蜡蝉总科25种(内群)和沫蝉总科(Cercopoidea)2种(外群)的低覆盖度全基因组测序数据和转录组数据，利用BUSCO提取单拷贝直系同源基因，使用Phykit根据核苷酸和氨基酸序列数据生成不同的完整性数据矩阵，分析蜡蝉总科的系统发育关系。【结果】基于低覆盖度全基因组测序数据和转录组数据得到蜡蝉总科单拷贝直系同源基因的数量为836～2 421。在蜡蝉总科的系统发育关系中，所有系统发育结果都支持菱蜡蝉科(Cixiidae)+飞虱科(Delphacidae)为蜡蝉总科其他科的姐妹群，且菱蜡蝉科、飞虱科、颖蜡蝉科(Achilidae)、袖蜡蝉科(Derbidae)、蜡蝉科(Fulgoridae)、象蜡蝉科(Dictyopharidae)、峻翅蜡蝉科(Acanaloniidae)、蚁蜡蝉科(Tettigometridae)、瓢蜡蝉科(Issidae)、杯瓢蜡蝉科(Caliscelidae)、广翅蜡蝉科(Ricaniidae)和扁蜡蝉科(Tropiduchidae)为单系群，而娜蜡蝉科(Nogodinidae)为非单系群。此外，基于4种不同矩阵利用最大似然法构建的系统发育结果支持蛾蜡蝉科(Flatidae)为非单系群。然而，基于氨基酸序列数据矩阵faa＿all包含的每个标记利用物种树构建的系统发育结果中却支持蛾蜡蝉科为单系群，但是有相对低的节点支持率。【结论】本研究利用低覆盖度全基因组测序数据和转录组数据得到的蜡蝉总科的系统发育关系与之前的研究结果多数一致。但是，有关各科之间的姐妹群关系还需要获得更多的标本和分子标记来进一步明确它们的系统发育关系。

摘要: 【目的】为探究丝殊角萤叶甲Agetocera filicornis (Laboissiere, 1927)线粒体基因组结构特征及叶甲亚科的系统发育关系。【方法】利用高通量测序方法测定丝殊角萤叶甲线粒体基因组序列。选择叶甲亚科Chrysomelinae和萤叶甲亚科Galerucinae的128个物种作为内群，选择肖叶甲亚科Eumolpinae的3个物种作为外群，利用最大似然法和贝叶斯法重建叶甲亚科的系统发育关系。【结果】丝殊角萤叶甲的线粒体基因组全长为15 814 bp，包含37个基因（13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和22个转运RNA基因）和一段非编码控制区。其线粒体基因组AT含量丰富（76.6%），并且AT偏斜为正值（0.053）,GC偏斜为负值（﹣0.252）。不同的系统发育分析方法构建的系统发育关系支持萤叶甲亚科为单系群，叶甲亚科为非单系群。【结论】本研究首次获得了丝殊角萤叶甲的线粒体基因组全序列。构建了叶甲亚科的系统发育关系，为更好地理解叶甲亚科、萤叶甲亚科和丝殊角萤叶甲的系统发育提供线粒体基因组数据。

摘要: 【目的】番茄潜叶蛾Tuta absoluta(Meyrick)是番茄作物上的重大害虫，自入侵我国以来，已经造成了严重的经济损失，因此为了追踪我国番茄潜叶蛾的遗传分化进程，分析其与世界其它地理种群的遗传关系，本研究对番茄潜叶蛾种群的遗传结构进行了分析。【方法】研究采用线粒体COⅠ基因作为分子标记，分别对COⅠ基因同源性、遗传变异、遗传多样性、生物分子变异组成进行了分析，最后构建了世界范围内的系统发育树。【结果】结果显示，我国甘肃和宁夏地区的地理种群已经发生了可遗传变异，其中甘肃出现了两种突变单倍型（China:GSLZ;China:GSLZ），宁夏为一种突变单倍型（China:NXWZ）；全球番茄潜叶蛾地理种群共检测到28个多态位点，存在18种单倍型，以塞内加尔地理种群单倍型最丰富，达10种，其次为肯尼亚；我国地理种群存在2个转换突变的简约信息位点，共3种单倍型，推测我国番茄潜叶蛾已经形成了一定的群体结构，但仍然处于入侵“瓶颈期”；总体而言，非洲番茄潜叶蛾遗传多样性最高，其次分别为南美洲和亚洲；分子生物学方差分析显示，引起种群变异的主要因素存在于种群内部，变异率占97.99%。系统发育分析表明，全球番茄潜叶蛾总体可以分为4个类群，以肯尼亚地理种群的变异种遗传距离较远，但我国甘肃兰州和宁夏两个地理种群突变种与肯尼亚KU565664.1突变种为同一单倍型，其它地理种群变异种均聚类在相同遗传发育节点之下。【结论】世界范围内番茄潜叶蛾单倍型多样性与核苷酸多样性等遗传多样性指标均较低，种群遗传具有高度同质性，但非洲番茄潜叶蛾的遗传多样性较高。在我国，番茄潜叶蛾种群在线粒体DNA分子水平上已经发生了明显分化，主要为C/T(China:GSLZ)和A/G(China:GSZY)转换突变。

摘要: 对纵肋扁甲Cucujus costatus的线粒体基因组进行测序、组装及注释，并对其基因组结构特征进行对比分析，构建基于13个蛋白质编码基因（PCGs）串联数据的扁甲科Cucujidae最大似然树。研究结果表明：纵肋扁甲线粒体基因组序列全长16 033 bp,A+T含量为77.28%，存在显著的AT偏向性。含有22种tRNAs，除trnS1外，其他tRNAs二级结构均为典型的三叶草结构。在PCGs中，ND6的Pi值最高（0.220）;COX2的Ka/Ks值最低（0.03）。系统发育研究结果表明：所有的扁甲科物种聚为一支，其中扁甲属Cucujus位于系统发育树的基部，该属中5个物种的系统发育关系为：未知扁甲Cucujus sp.与红扁甲C. clavipes构成姐妹群，蓝翅扁甲C. mniszechi与肯氏扁甲C. kempi构成姐妹群，2组姐妹群进一步与纵肋扁甲构成姐妹群。结果为深入研究扁甲科的线粒体基因组特征及系统发育分析提供了基础数据，也为后续分类创造了条件，提高了该科分子生物学的认知水平。