检索结果(检索关键词为:遗传多样性;结果共29条)
  • 郑海钱; 徐志旺; 徐康宁; 李卉; 李树然; 张永普
    四川动物 2022年第41卷第4期 DOI:
    关键词: 线粒体基因;;青藏高原;;两栖动物;;海拔;;遗传多样性
    摘要: 高原林蛙Rana kukunoris是中国特有的两栖动物,分布于青藏高原海拔2 000~4 400 m的湿润环境。为探究青藏高原的高原林蛙遗传多样性,将4个线粒体基因(COⅠ、cyt b、12S rRNA和16S rRNA)序列合并成联合数据集,对采自青海省4个海拔梯度(2 000 m、2 600 m、3 200 m和3 800 m)的100只高原林蛙个体进行测序分析。结果表明,2 000 m和2 600 m的高原林蛙群体的多态位点、单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数高于3 200 m和3 800 m群体;4个群体均出现了高单倍型多样性、低核苷酸多样性的结果。高原林蛙遗传分化主要发生在群体间,中性检验和错配分析表明,高原林蛙群体可能没有经历扩张事件。cyt b基因在2 600 m、3 200 m和3 800 m群体都检测到了正选择位点。综上所述,2 000 m和2 600 m的高原林蛙群体遗传多样性高于3 200 m和3 800 m群体,4个海拔群体的遗传分化程度较高;cyt b基因可能对高原林蛙适应高海拔环境起到了积极作用。本研究可为理解高原林蛙适应高原环境及其保护提供参考。

  • 杨朝杰; 高强; 刘丹; 聂苗苗; 王发艳; 李柯懋; 赵宏; 张存芳; 祁得林
    四川动物 2022年第41卷第4期 DOI:
    关键词: 软刺裸裂尻鱼;;D-loop;;遗传多样性;;种群遗传结构
    摘要: 软刺裸裂尻鱼Schizopygopsis malacanthus是青藏高原特有鱼类。本研究测定了青海省玉树藏族自治州3个软刺裸裂尻鱼野生群体(隆宝滩国家级自然保护区、巴塘河上游、巴塘河下游)共72尾的mtDNA D-loop的部分序列(610 bp),分析了其遗传多样性和种群遗传结构,旨在为玉树软刺裸裂尻鱼野生资源保护和合理开发提供理论依据。共发现29个多态位点,定义了16个单倍型。3个种群的单倍型多样性为0.438±0.121~0.676±0.076,核苷酸多样性为0.003 4±0.000 5~0.008 6±0.001 3。群体遗传分化指数统计检验表明,两两群体之间的差异均极显著。基因流分析结果表明,巴塘河上、下游种群之间的基因流水平较高,个体交流频繁。AMOVA分析结果显示,79.49%的遗传变异来自于种群间,20.51%的遗传变异来自于种群内,群体间遗传分化极显著。系统发育树和单倍型进化网络结果显示,3个种群的单倍型按照隆宝滩国家级自然保护区和巴塘河水系形成2大类群。中性检验结果表明,软刺裸裂尻鱼近期未出现显著的种群扩张事件。建议将分布在隆宝滩国家级自然保护区和巴塘河水系的软刺裸裂尻鱼作为2个进化单元分开管理。

  • 刘世梁; 林玉成
    四川动物 2022年第41卷第3期 DOI:
    关键词: 云南洞密蛛;;COⅠ基因;;单倍型;;基因流;;种群遗传分化;;遗传多样性
    摘要: 云南洞密蛛Trogloneta yunnanense(Song&Zhu, 1994)是生活在云贵高原的一种洞穴蜘蛛。本文基于6个洞穴种群159只个体样本的线粒体COⅠ基因,初步探讨了该物种的种群结构和遗传多样性特征。研究结果表明:1)159个样本共检测到16个单倍型,种群间无共享单倍型,遗传多样性呈现出总体高、种群内低、单倍型多样性高、核苷酸多样性低的模式;2)种群间遗传分化极显著,种群内变异小,种群间F<sub>ST</sub>值均在0.9以上(P<0.01),种群间基因流小(Nm=0.01),种群间变异占总变异的95.75%,种群内变异仅占4.25%;3)中性检验和核苷酸错配分布检验显示,云南洞密蛛未经历种群扩张,群体大小保持稳定。推测洞穴隔离和地下极端环境条件可能维持着云南洞密蛛的种群规模稳定,同时促进其种群间的遗传分化。

  • 刘思霞; 张馨元; 晏鸣霄; 杜焓瑜; 杨金城; 李广龙; 官文渊; 杨守庄; 徐艳春
    野生动物学报 2022.0年第43卷第04期 DOI:
    关键词: 绿孔雀;;遗传多样性;;遗传结构;;近交
    摘要: 绿孔雀(Pavo muticus)是备受关注的濒危物种。我国南方曾广泛分布的云南亚种(P.m.imperator)目前收缩到中部、南部和西部的局部地区,近年来陆续开展了野外种群调查,但遗传多样性的分析和评估尚未开展。本研究利用从玉溪市新平和峨山交界处采集的野外绿孔雀自然脱落的羽毛,采用11对微卫星标记分析遗传多样性和结构,并与国内主要圈养种群(建群者来自瑞丽地区和其他未确定的地点)进行比较。结果表明:该野生种群的遗传多样性较低,受到近交的影响,遗传多样性进一步丢失的风险较高。遗传结构上,该野生种群和圈养种群的个体被划分为3个亚群,野生种群作为独立的1个亚群,在遗传上有别于圈养种群所含的2个遗传谱系,说明云南省分布的绿孔雀有着显著而复杂的地理分化。当前需要开展系统的谱系地理学研究,以加强族群之间的基因交流为目标,通过生态廊道或个体转移等方式增加遗传交流的机会,扭转遗传多样性随近交的深化而不断丢失的趋势。

  • 耿广耀; 由玉岩; 刘群秀
    野生动物学报 2022.0年第43卷第03期 DOI:
    关键词: 豚鹿;;微卫星;;分子标记开发;;遗传多样性
    摘要: 以上海动物园圈养豚鹿(Axis porcinus)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记。结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2~5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(H<sub>e</sub>)为0.513。7个SSR标记中有3个高度多态标记、 3个中度多态标记和1个低度多态标记,可用于豚鹿的遗传多样性研究。