摘要: 小熊猫是亚洲特有的珍稀濒危动物,目前受到栖息地减少、片断化和人类活动干扰等威胁。中国圈养小熊猫已经有60多年历史,约55个机构曾经饲养过小熊猫,现今圈养数量有400多只,评估小熊猫圈养种群的遗传多样性和遗传结构对科学维持圈养种群和保存遗传种质资源意义重大。本研究利用19个微卫星座位,对中国境内11个小熊猫圈养种群的116只个体进行了遗传多样性评估及遗传结构分析。结果显示11个种群都具有较高的遗传多样性,平均基因丰富度3.505±1.033(北京)至4.026±1.219(冕宁),期望杂合度0.631±0.225(黄山)至0.782±0.171(温岭)。其中福州和无锡种群极显著偏离Hardy-Weinberg平衡。整个圈养群体内各个种群遗传分化系数为0.055,呈显著分化,表明11个种群遗传分化水平较高。Bayesian遗传聚类分析将11个种群聚为三个遗传簇,与野生种群的遗传聚类结果一致。结论:小熊猫圈养种群与野生种群相比,同样具有较高的遗传多样性。因此,圈养小熊猫遗传管理的重点不再是引进野生个体充实圈养种群,应制订科学的繁殖计划,避免近交,从而维持圈养种群的遗传多样性。

摘要: 为了解珠江流域重要野生经济鱼类赤眼鳟的遗传多样性和遗传分化现状,对柳江、西江、北江、郁江、南盘江和红水河6个自然种群共170尾个体的线粒体控制区(D-loop)序列进行测定与分析.结果显示,共获得长978 bp的序列,检测出106个单倍型,单倍型多样性平均为0.982 0,核苷酸多样性平均为0.013 53,表明珠江流域赤眼鳟具有较高的遗传多样性.遗传距离和遗传分化结果均显示珠江流域赤眼鳟未出现明显分化,各种群亲缘关系较近.基于D-loop序列构建的NJ树显示,106个单倍型分为两大支系(A支和B支).A支包含6个种群中的大部分单倍型,未形成明显单系群;B支由西江种群的两个特有单倍型组成.单倍型网络亲缘关系分析结果也表明其未出现明显分化.AMOVA分析结果表明,绝大部分变异出现在种群内(99.36%),而地理区间和地理区内种群间的变异很小.中性检验显示,珠江流域赤眼鳟历史上曾发生过种群扩张.综合上述研究结果,认为西江为珠江流域赤眼鳟的扩散中心.

摘要: 为评价圈养及野生藏酋猴Macaca thibetana子代遗传多样性的差异,本研究利用藏酋猴线粒体控制区(mt DNA D-loop)全长序列,对四川省金阳地区野生亲本及子一代、马边地区野生亲本及圈养繁殖子一代共102只个体开展了遗传结构变异分析。结果显示,藏酋猴mt DNA D-loop的序列长度为1 091 bp,包括115个变异位点,66个单倍型,其中,马边种群亲本与子一代共享2个单倍型,金阳种群亲本与子一代共享1个单倍型。马边种群2个世代个体的核苷酸多态性分别为0.004 77和0.004 09;而金阳种群2个世代个体的核苷酸多态性分别为0.002 30和0.002 78,子一代与亲本的遗传多样性差异无统计学意义,均处于较低水平。马边和金阳地区子一代与亲本之间的遗传距离分别为0.024 09和0.002 55,表明圈养和野生条件下的子一代与亲本间均未出现明显的遗传分化。根据D-loop全长序列所构建的邻接(NJ)树显示,金阳或马边地区的不同世代个体在NJ树上互相交叉,未形成独有的进化支,说明无论自然条件下的随机交配还是圈养繁育的人为选择压力均没有对藏酋猴种群的遗传结构造成大的影响。本研究首次利用mt DNA D-loop全长序列分析藏酋猴野外与圈养繁殖的亲本与子一代间的遗传差异,为藏酋猴实验动物遗传控制标准化提供数据支持。

摘要: 本研究以线粒体DNA Cyt b基因为分子标记,对塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis) 3个地理种群的遗传多样性进行了评价,并运用SPSS 19. 0和Canoco 4. 5软件对生存在不同生境中的塔里木马鹿和天山马鹿进行了比较,以进一步探讨了塔里木马鹿种群遗传多样性与环境因子之间的关系。遗传分析结果表明:塔里木马鹿且末种群具有相对较低的单倍型多样性(H=0. 363±0. 152)和核苷酸多样性(π=0. 005±0. 003),沙雅种群具有相对较高的单倍型多样性(H=0. 911±0. 059)和核苷酸多样性(π=0. 016±0. 002);种群之间的基因流(Nm)和遗传分化程度(FS T)显示,塔里木马鹿各地理种群具有显著的遗传分化。马鹿种群遗传多样性与环境因子的相关性分析表明:塔里木马鹿和天山马鹿种群的遗传多样性与年均降水量(r=0. 783)和海拔(r=0. 997)呈显著的正相关,与纬度(r=0. 414)呈正相关性,与年均无霜期、年均气温、年均日照、经度、人口、年均畜牧数量和年均耕地面积呈负相关性。蒙特卡洛里检验的结果表明:显著影响塔里木马鹿种群遗传多样性的环境因子分别为年均气温(r=0. 852,F=7. 450,P=0. 038)、年均降水量(r=0. 612,F=6. 240,P=0. 050)、人口(r=-0. 816,F=7. 370,P=0. 046),因此这些因素是主要的环境因子。

摘要: 蒙古野驴是生活在亚洲中部荒漠、半荒漠和荒漠草原重要的珍稀有蹄类动物。采用PCR和测序技术,我们成功测定新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区日常监测时获得的26匹蒙古野驴(Equus hemionus)样本的mt DNA D-loop区核酸序列,对蒙古野驴的遗传多样性及其系统发育地位进行了初步研究。研究结果发现该区域蒙古野驴核苷酸多样性较高(π=0. 20392±0. 05230),单倍型多样性与其他马科动物大致相同(Hd=0. 982±0. 020)。表明新疆卡拉麦里有蹄类自然保护区蒙古野驴的遗传多样性十分丰富。Tajima's D值为负,中性检验不显著(P> 0. 10),表明新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区的蒙古野驴在整体水平上并未出现过瓶颈效应或者快速扩张等历史事件。采用邻接法(NJ)和最大似然法(ML)构建单倍型之间的进化树,结合Network构建的单倍型间网络图显示2个重要分支。我们通过历史分布及地理位置推测卡拉麦里山有蹄类自然保护区的蒙古野驴可能存在外来种群的迁入。将本研究得到的蒙古野驴序列与Gen Bank检索获得的另外7种马科动物的mt DNA D-loop区基因进行比较,发现马科动物分化过程中平原斑马出现最早,山斑马首先分离出来,然后是蒙古野驴、藏野驴、努比亚野驴、细纹斑马,最后是普氏野马与非洲野马,其中与蒙古野驴最接近的物种是藏野驴。