摘要: The gene of 12S rRNA exhibits a high degree of conservation during animal evolution. Its sequence shows partial difference among species but little variation among individuals of the same species. Therefore, the 12S rRNA could be used to perform intra-and inter-specific identification studies. All the deer of genus Muntiacus become endangered due to excessive poaching and thus protected by Chinas Wildlife Protection Law at the national and provincial level. In this study, we employed the sequencing of 12S rRNA to identify two confiscated samples and found out that the two samples were Muntiacus crinifons and Muntiacus reevesi, respectively. The sequence of the 12S rRNA adopted in this study proved to be a suitable genetic marker for species identification of conservation animals.

摘要: 动物的活动节律是行为生态学中的一个重要内容,它主要研究动物在不同时间内的活动强度及变化规律(原宝东和孔繁繁,2011)。黑麂(Muntiacus crinifron)隶属偶蹄目(Artiodactyla)鹿科(Cervidae)麂属(Muntiacus),属国家一级保护动物,其分布范围十分狭小,目前该种群仅存于安徽、浙江、江西和福建4省,且栖息地成小种群岛屿状分布(盛和林,1987)。

摘要: 近年来,由于人类活动的干扰使黑麂的栖息地明显减少并呈斑块状分布。因此,深入了解该物种各地理分布种群的遗传现状是制定保护及管理策略的重要科学依据。本研究运用非损伤取样技术在浙江省九龙山国家级自然保护区的黑麂分布区共采集61份粪便样品、2份肌肉样品和2份皮张样品,采用8个特异微卫星位点对61份粪便样品中提取的DNA进行检测,肌肉和皮张样品DNA的检测结果作为对照,分析了九龙山国家级自然保护区黑麂种群的遗传多样性。经多次重复提取和PCR扩增后,发现61份粪便样本中有38份可被稳定扩增,且不同样本间的条带大小有较大差异,因此我们认为38份粪便样本来源于38只不同的黑麂个体。8个微卫星位点共检测到50个等位基因,平均等位基因数(A)为6(5～8);平均有效等位基因数(Ne)为5.297(4.031～6.353);平均期望杂合度(He)为0.817(0.763～0.855);平均多态信息含量(PIC)为0.775(0.709～0.822)。8个位点的平均个体识别率(DP)为0.931,累积个体识别率(CDP)为0.9999。有1个微卫星位点(BM1706)极显著地偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。以上结果显示该分布区黑麂种群具有较高的遗传多样性。

摘要: 利用牛特异性扩增DQA2第2外显子的嵌套引物,对黑麂基因组DNA进行PCR扩增和克隆测序,基于该序列设计出黑麂DQA2基因第2外显子特异性引物。利用该引物,通过PCR-SSCP以及克隆测序技术,从40个黑麂样品中获得4个不同的DQA2等位基因。没有一个个体同时具有2个以上的等位基因,所有序列均不含插入或缺失突变,不含终止密码子,因此,本研究所扩增的DQA2基因可能是表达的单基因座位。抗原结合区(Pep-tide binding region,PBR)非同义替换率(dn)显著大于同义替换率(ds)(P<0.05),暗示该座位曾经历过明显的正选择作用;进一步利用CODEML程序中的相关模型以及贝叶斯法检测出4个受选择作用的氨基酸位点(α11、α58、α62、α66),这4个位点均位于PBR区。基于NJ法构建的部分偶蹄类DQA外显子2系统发生关系显示,黑麂4个DQA2等位基因与牛、羊以及梅花鹿的DQA2等位基因构成独立的进化枝,在该进化枝内,黑麂DQA2等位基因优先与牛DQA2等位基因聚类,暗示黑麂DQA2基因在进化过程中存在跨物种进化现象。上述结果表明平衡选择是维持黑麂DQA2基因多态性的主要机制。然而,本研究从40个样品中仅检测出2个杂合子,黑麂DQA2等位基因之间的频率存在显著差异,推测可能是所检测的样品来源于不同种群,由于华伦德效应(The Whalund effect)导致杂合度降低,也不排除本文所设计的引物在PCR扩增过程中存在无效等位基因。

摘要: 黑麂自1885年由Sclater定名以来,其分布区信息主要来自20世纪30～80年代,且局限于安徽省的东部和南部,浙江省的西部和南部以及与安徽、浙江交界的江西省玉山、婺源、浮梁和福建省浦城等四十几个县域(Allen,1940;Sheng and Lu,1980;盛和林和吴天荣,1981;盛和林和陆厚基,1982;夏武平,1988;张荣祖,1997),最近一次的黑麂新分布地报道为1980年在武夷山脉东坡的