摘要: 为深入了解我国黑线姬鼠Apodemus agrarius 5个亚种的遗传分化特征，本研究结合扩增子测序技术，获得了我国16省524只黑线姬鼠的线粒体cyt b基因序列，并对其进行遗传多样性和系统进化分析。结果共检测到226个不同的cyt b单倍型，核苷酸多样性分析显示，分布于秦岭-淮河线以南的南方种群，其多样性为0.014 8，明显高于东北种群的0.009 8和华北种群的0.009 5。系统进化和遗传分化系数(F_st)分析结果显示，南方种群和台湾种群的cyt b单倍型相对较古老，且与东北种群和华北种群间的F_st为0.115～0.672，产生了明显的遗传分化，而东北种群与华北种群之间遗传分化程度不明显。黑线姬鼠很可能起源于我国南部地区，海陆隔离在台湾亚种的分化中起着重要的作用，南部种群继续向北方和东北方向扩散，形成华北亚种和东北亚种，东北种群向古北界西部扩散形成指名亚种。研究结果为将来深入了解黑线姬鼠的亚种分化、扩散和生态适应性问题提供了重要的参考。