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检索结果(检索关键词为:颜氏大疣蛛;结果共2条)
颜氏大疣蛛毒腺转录组学研究
顾小亮; 殷文豪; 酉勇明; 吴亚应; 丁丽君; 王颖; 巫秀美; 张成桂; 杨自忠
环境昆虫学报 2023年第45卷第3期
DOI:
关键词: 颜氏大疣蛛,高通量测序,转录组,差异表达基因,生物信息学
摘要: 颜氏大疣蛛Macrothele yani个体大、毒性强、易取毒,是农林生态系统中害虫的重要天敌,也是天然药物研究工作者进行新药挖掘和毒液开发利用的重要选择对象。本研究利用高通量测序平台Illumina Hiseq 2000对颜氏大疣蛛雌雄成体的毒腺进行转录组测序和生物信息学分析,共获得转录组样本数据37.8 G,总计301 024条unigenes,总长度170 512 372 bp,最短201 bp,最长36 105 bp,平均长度566 bp, GC含量平均值为38.17%,N50长度为705 bp。将unigenes序列与NR(非冗余蛋白序列数据库)、String(蛋白质相互作用数据库)、Swiss-prot(蛋白质序列数据库)、Pfam(蛋白质家族数据库)、GO(基因本体论)、KOG(真核生物蛋白质直系同源数据库)、KEGG(京都基因与基因组百科全书)数据库进行比对(e≤10~(-10)),分别获得31 409、6 549、11 817、8 216、11 480、7 804条unigenes注释。通过生物信息学对雌雄颜氏大疣蛛unigenes进行表达量分析,筛选高表达量且高可信度的差异表达基因,并进行对这些差异基因进行GO和KEGG功能富集分析;与雄蛛相比,雌成体有205条unigenes表达量上调,113条unigenes表达量下调。最后在所有的转录本数据中共比对到68条毒素相关序列。本研究获得的颜氏大疣蛛转录组信息,为颜氏大疣蛛的功能基因挖掘提供了重要的信息资源。
颜氏大疣蛛蛛毒中多肽和蛋白质的多样性分析
王梦如; 张秀清; 王颖; 周思彤; 杨自忠; 李龙星; 杨志斌
四川动物 2019年第38卷第4期
DOI:
关键词: 颜氏大疣蛛;;蛛毒;;多肽;;蛋白质;;多样性
摘要: 对颜氏大疣蛛Macrothele yani蛛毒所富含的多肽与蛋白质多样性进行探索,采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳和超高效液相色谱-电喷雾-四极杆-飞行时间质谱技术分离和鉴定颜氏大疣蛛蛛毒中的蛋白质和多肽,并对其相对分子质量分布多样性进行分析。结果显示:粗毒中所含蛋白质的相对分子质量主要分布在35 kDa以上。在17~135 kDa分离度较佳的共有11条电泳条带,主要集中于40~120 kDa附近;在75 kDa附近弥散着高丰度的蛋白条带,75 kDa以上的蛋白质最丰富。粗毒经色谱分离后得到超过50个色谱峰,经质谱鉴定得到121个物质成分,其中,多肽类物质的相对分子质量呈双峰式分布,21%分布在500~2 000 Da,76%分布在3 000~5 000 Da,为粗毒中多肽含量最丰富的部分,且集中于35~60 min的保留时间内被洗脱。研究结果表明,颜氏大疣蛛蛛毒中含有较为丰富的多肽和蛋白类物质,这些物质的相对分子质量分布特征与已报道的其他蜘蛛既有相似性又存在具体差异。本文展示了颜氏大疣蛛蛛毒的分子多样性,为后续该毒素的物质基础研究及药用价值开发提供参考。
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