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检索结果(检索关键词为:西伯利亚鲟;结果共17条)
西伯利亚鲟Tbx3基因的克隆和表达分析
张昊; 范纯新; 宋佳坤
Zoological Research 2012年第33卷第2期
DOI:
关键词: 西伯利亚鲟;;软骨硬鳞鱼;;Tbx3;;结构;;表达
摘要: Tbx3基因是一类重要的转录因子,在形态发生和器官形成中发挥着重要作用。该文克隆了西伯利亚鲟Tbx3基因(AbTbx3)cDNA的全长序列,该cDNA全长2908bp,包含一个2166bp的开放阅读框,编码721个氨基酸的多肽。分析表明:AbTbx3和人Tbx3的T-box结构域蛋白序列同源性达到95.2%,三维结构也具有高度的相似性。系统进化分析表明:AbTbx3与其他物种的Tbx3聚为一支,并在一个大的分支上与Tbx2聚类。半定量RT-PCR显示,AbTbx3基因从西伯利亚鲟囊胚早期即开始表达,且随着发育表达渐强,至尾芽早期表达量达到最大,随后稍有下降;在成体的眼、脑、鳃、肠、胸鳍和腹鳍中有表达,在肝、血液、心脏、肾和肌肉中均未检测到其表达。整体原位杂交表明,在37期和43期仔鱼的耳泡、后脑、松果体和后部脊索中表达量较高,同时在背鳍芽中也有表达。综上结果表明:西伯利亚鲟Tbx3与人Tbx3在结构上高度同源,在胚胎、仔鱼和成体中呈时空特异性表达。
五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析
王巍; 朱华; 胡红霞; 田照辉; 董颖
Zoological Research 2009年第30卷第5期
DOI:
关键词: 线粒体控制区;;西伯利亚鲟;;史氏鲟;;小体鲟;;达氏鳇;;俄罗斯鲟;;重复序列;;异质性
摘要: 利用保守引物得到5种鲟鱼的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)全长,长度在795~813bp。序列中包括了CBS(conserved sequence block)和TAS(term ination-associated sequence)区域。利用最大似然法、最大简约法和贝叶斯法构建了系统发育树,发育树分成两枝,呈现明显的生物地理分布。分析表明,现有的鳇属鱼类不是单系群起源。5种鲟鱼D-loop序列都存在长度和数目不等串联重复序列,长度在78~82bp之间,重复序列拷贝数在4~6次不等,因此造成了mtDNA广泛的异质性现象。不同种类的重复序列单元十分相似,达氏鳇和史氏鲟重复序列单元相似度为82.93%,西伯利亚鲟和俄罗斯鲟重复序列单元相似度为90.59%。在串联重复序列后是一段不完全重复序列。通过与已有同种的重复序列比对发现不同鲟鱼重复序列相同,不同地理区域相同物种的重复序列可能发生过分子内重组。这些表明重复序列在鲟鱼进化上具有相关意义,推测重复序列可能产生在种分化前,重组发生在种分化后。
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