摘要: 利用单细胞转录组测序技术在细胞水平探究花斑裸鲤（Gymnocypris eckloni）肾、肝和脾三种造血器官中的细胞组成类型，系统描绘花斑裸鲤这三种造血器官的细胞图谱，为进一步研究花斑裸鲤造血系统发育，尤其是红细胞发育积累科学数据。研究方法包括花斑裸鲤肾、肝和脾三种造血器官的单细胞悬液制备、单细胞RNA-seq文库构建、测序以及降维聚类分析、细胞注释、差异基因分析和功能富集分析。结果表明，花斑裸鲤三种造血器官内存在类型丰富的细胞，包括红细胞、中性粒细胞、T细胞、B细胞、树突状细胞、上皮细胞、巨噬细胞、血管内皮细胞、肌细胞、成纤维细胞、单核细胞和神经细胞。在三种器官中细胞分布存在较大的异质性：脾中参与发挥红细胞功能的细胞群分布占比较大；肾中参与免疫反应的细胞群分布占比较大；肝中血管内皮细胞和肌细胞分布占比较大。在功能方面，花斑裸鲤与多数硬骨鱼类相似，它的肾、脾和肝不仅参与造血及红细胞的发育，而且对于免疫系统的发育和应答等过程也发挥一定作用。本研究从单细胞角度对花斑裸鲤造血系统发育研究进行了一定的补充与完善，展现了三种造血器官中细胞分布的特征与差异，对于后续进一步预测花斑裸鲤的红细胞发育路径提供了一定的研究基础。

摘要: 花斑裸鲤(Gymncypris eckloni)主要分布于黄河上游高原宽谷河段深水缓流处或静水湖泊中,在高原淡水生态系统的食物链中具有重要的地位。本文获得了黄河上游花斑裸鲤5个种群共68个个体线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b基因的全序列(1140bp),分析了序列变异和种群遗传多样性。68个序列经比对后,发现30个(2.63%)多态性位点,共定义了18个单倍型。结果显示,花斑裸鲤种群单倍型多样度和核苷酸多样度均低于其它鲤科鱼类,这可能与青藏高原经所经历的地质变迁和古气候环境的改变有关,由此生活在高原水域中的鱼类或多或少经历过瓶颈效应。AMOVA分析结果显示,遗传差异主要发生在种群之内,而不是来自不同地理组群间或组群内种群间。单倍型网络图和系统发育分析均没有显示出单倍型与地理位置的对应关系,提示黄河上游花斑裸鲤自然种群未出现分化,应作为一个整体进行保护。单倍型歧点分布呈现为单峰以及中性检验Fu’sFs(-15.3400,P<0.001)和Tajima’sD(-0.6254,P=0.3080)结果综合表明,花斑裸鲤可能经历过近期的种群扩张事件。