摘要: 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了黄脸油葫芦(Teleogryllus emma)线粒体基因组全序列。结果表明,黄脸油葫芦的线粒体基因组全长15660bp,A+T含量为73.1%。谷氨酸、色氨酸及天冬酰胺的转运RNA基因由N链编码,形成了直翅目中的第三种基因排列顺序,其余结构与其它螽亚目昆虫的线粒体结构一致。基因间隔序列共计73bp,间隔长度从1—24bp不等;有14对基因间存在共54bp重叠,重叠碱基数在1—11bp之间。13个蛋白质编码基因中12个基因(除COⅠ基因外)的起始密码为标准的ATN组成,COI基因的起始密码子为TTA。有10个基因在基因3'端能找到完全的TAA或TAG终止密码子,而有三个基因(COII,ND5和ND4)终止密码子为不完整的T。除tRNASer(AGN)外,其余21个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。黄脸油葫芦940bp的A+T富集区中存在一个被认为与复制起始有关的保守的二级结构,该结构不仅存在于直翅目昆虫中,而且也存在于双翅目、鳞翅目和膜翅目中,但是未见于昆虫纲的早期分化类群——弹尾目中。

摘要: 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了短额负蝗的线粒体基因组全序列。结果表明,短额负蝗的线粒体基因组全长15558bp,A+T含量为74.3%,37个基因位置与飞蝗的一致,基因间隔序列共计11处64bp,间隔长度从1～16bp不等;有15对基因间存在51bp重叠,重叠碱基数在1～8bp之间。13个蛋白质编码基因中找到6种可能的起始密码子,有12个基因在基因3'端能找到完全的TAA或TAG终止密码子,只有ND5基因终止密码子为不完整的TA。除tRNASer(AGN)外,其余21个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。tRNASer(AGN)的DHU臂缺失,在相应的位置上只形成一个环。预测的lrRNA二级结构总共有6个结构域(结构域Ⅲ缺失),49个茎环结构。预测的srRNA的二级结构包含3个结构域,33个茎环结构。A+T丰富区中存在一个被认为与复制及转录起始有关的Ploy(T)(T-stretch)结构。

摘要: 该研究基于直翅目56种昆虫的COI基因全序列构建了该目部分类群间的系统发育关系,同时也分析了COI基因编码的氨基酸序列构建直翅目系统发育关系的可靠性。将COI序列按照密码子一、二、三位点划分,分别计算PBS(partioned Bremer support)值,评估蛋白质编码基因密码子不同位点的系统发生信号强度。分析结果支持螽亚目和蝗亚目的单系性;剑角蝗科、斑腿蝗科、斑翅蝗科、网翅蝗科和槌角蝗科5科均不是单系群,科间的遗传距离在0.107～0.153之间变化,与其他科相比遗传距离较小,符合将这5科合并为一科(即蝗科)的分类系统,瘤锥蝗科和锥头蝗科归为锥头蝗总科,癞蝗科单独成为一科,这也与Otte(1997)系统的划分一致。根据PBS值的大小推断密码子第三、第一位点对系统树分支的贡献比第二位点大,并且较长的序列含有较多的信息位点。研究也证实将各物种COI基因之间的遗传距离作为直翅目划分科级阶元的工具是可行的。

摘要: 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了李氏大足蝗(Aeropus licenti Chang)的线粒体基因组全序列。结果表明,李氏大足蝗的线粒体基因组全长15597bp,A+T含量为74.8%,37个基因位置与飞蝗的一致,基因间隔序列共计17处105bp,间隔长度从1～21bp不等;有10对基因间存在58bp重叠,重叠碱基数在1～17bp之间。13个蛋白质编码基因中找到4种可能的起始密码子;有12个基因在3'端找到完全的TAA或TAG终止密码子,只有ND5基因终止密码子为不完整的T。除tRNASer(AGN)外,其余21个tRNA的二级结构均属典型的三叶草结构。tRNASer(AGN)的DHU臂缺失,在相应的位置上只形成一个环。预测的lrRNA二级结构总共有6个结构域(结构域Ⅲ缺失),47个茎环结构;预测的srRNA的二级结构包含3个结构域,31个茎环结构。A+T丰富区长度为712bp。

摘要: 【目的】深入了解双带麻螽Tapiena bivittata线粒体基因组的特征，揭示其与其他露螽亚科Phaneropterinae昆虫的亲缘关系，进一步理解该亚科的系统发育关系，本研究对双带麻螽的线粒体基因组进行了测序和分析，并探讨了其系统发育地位。【方法】利用高通量测序技术测定双带麻螽线粒体全基因组序列，完成拼接、注释和分析。基于测定的双带麻螽线粒体基因组序列和已报道的露螽亚科21种昆虫的线粒体基因组序列，分别提取13个蛋白质编码基因和2个rRNA基因，利用贝叶斯法构建露螽亚科的系统发育关系。【结果】双带麻螽线粒体全基因组长度为16 414 bp，包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区。其基因排列紧凑，且与昆虫祖先序列的基因排序一致。双带麻螽线粒体基因组的A+T含量为69.7%。在13个蛋白编码基因中，除COX1和ND1以TTG为起始密码子外，其余均为ATN；除COX2、COX3、ND5和ND4使用不完整的终止密码子T外，其余均以TAG或TAA作为终止信号。22个tRNA中，除tRNA^Ser（AGN）外，其余均为典型的三叶草结构。贝叶斯系统发育树显示，双带麻螽与糙颈螽属Ruidocollaris的3个物种——凸翅糙颈螽Ruidocollaris convexipennis、污翅糙颈螽Ruidocollaris obscura和中华糙颈螽Ruidocollaris sinensis聚为一支，表明其与糙颈螽属的亲缘关系最近。【结论】本研究成功获得了双带麻螽的完整线粒体基因组序列，首次揭示了其结构与组成特征，并利用线粒体基因组数据构建了露螽亚科的系统发育树，为进一步研究露螽亚科的系统进化和完善其分类系统提供了新的分子数据支撑。