摘要: 种群数量和遗传多样性是保护濒危物种所需的基础信息。欧亚水獭(Lutra lutra)属于国家二级保护动物，曾经在我国分布广泛，但在20世纪经历了大规模的种群数量下降和分布区缩减。欧亚水獭相关研究十分缺乏，种群数量调查和遗传多样性等基础研究亟待开展。本研究采用非损伤性取样法，于2019—2020年在青海省玉树藏族自治州玉树市和四川省广元市青川县的主要河流共采集270个欧亚水獭粪便样品并进行DNA提取，基于9个微卫星位点和SRY基因分子标记进行个体识别和性别鉴定，进而使用非损伤性标志重捕法Capwire估计两地水獭的种群数量，并基于微卫星分型数据评估两个种群的遗传多样性。最终共有67个粪便样品(24.8%)成功分型7～9个微卫星位点并用于个体识别，共识别出玉树市10个个体、青川县30个个体，雌雄性比分别为4：5、15：14，两地各有1个个体未成功鉴定性别。估计研究区域内玉树的水獭种群数量为13只(95%置信区间：7～21只)、青川县的水獭种群数量为75只(95%置信区间：59～133只)。玉树、青川种群的平均观测杂合度HO分别为0.680、0.664，平均期望杂合度HE分别为0.611、0.658，表明两个水獭种群均具有中等的微卫星遗传多样性。玉树、青川种群的平均FST为0.238，平均近亲繁殖系数FIS分别为-0.121、-0.010，表明两个水獭种群之间分化显著，且种群内近交程度低。本研究是我国大陆地区基于粪便DNA对欧亚水獭进行种群数量估计和遗传多样性评估，可为我国水獭的保护提供重要的基础信息。