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检索结果(检索关键词为:棘腹蛙;结果共9条)
双团棘胸蛙与棘腹蛙酯酶同工酶的比较研究
孙爱群; 苏丽; 周未; 方小超; 沙伟
四川动物 2011年第30卷第2期
DOI:
关键词: 棘蛙属;;双团棘胸蛙;;棘腹蛙;;酯酶同工酶
摘要: 采用垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对六盘水境内的双团棘胸蛙Paa yunnanensis与棘腹蛙P.boulengeri的肝、肠、胃、肺等4种组织中的酯酶(EST)同工酶进行了研究。结果显示:两种蛙酯酶同工酶共有10条带,其中双团棘胸蛙EST同工酶有9条带,棘腹蛙EST同工酶有7条带,两种蛙EST同工酶存在较大的种间差异,同种蛙不同组织的酯酶(EST)同工酶迁移率、表达强度也不同。双团棘胸蛙酯酶同工酶酶谱较棘腹蛙的复杂。
棘腹蛙线粒体局部重复序列非排序聚类
曹跃; 夏云; 郑渝池
四川动物 2018年第37卷第3期
DOI:
关键词: 棘腹蛙;;线粒体DNA;;非排序比对;;聚类;;重复序列;;拓扑结构距离;;蛋白编码序列;;最大似然树
摘要: 动物线粒体基因组发生局部串联复制后,涉及区域具有多基因拷贝、假基因化、大量插入缺失的特点,难以排序和构建基因树。而不依赖排序的聚类方法理论上可用来归纳和展示这类序列的差异,但未见相关评估和运用。本研究选取棘腹蛙Quasipaa boulengeri 19号个体,以3类常用的基于特定长度(k)子序列集的非排序算法,依次设k值为4、6、8……20,对其轻链复制起点邻近复制区域583~695 bp的序列进行聚类。构建相同个体线粒体1 518 bp蛋白编码序列最大似然树为参照,计算和考查两者间拓扑结构距离和差异。所评估的28种算法中,半数可在主要为8的特定k值下产生和最大似然树拓扑结构相差仅2个节点(11.8%)的聚类树,部分算法在不同k值下均表现不佳,较小的k值(4)适合解析差异程度相对较高的序列间关系。这些结果例证了动物线粒体重复序列非排序聚类的可行性,其中的算法、k值理想组合可能适合类似系统。建议对其他类型的复制重排系统进行类似评估。
利用RNA-seq技术分析棘腹蛙编码区微卫星特征
姜玉松; 樊汶樵; 徐敬明
四川动物 2016年第35卷第1期
DOI:
关键词: 高通量测序;;棘腹蛙;;微卫星
摘要: 棘腹蛙Paa boulengeri的遗传研究和基因组信息比较匮乏,致使可有效利用的分子标记非常有限。以棘腹蛙RNA-seq高通量测序数据为基础进行微卫星分子标记的大规模发掘和特征分析,结果显示:在121.6 Mb的棘腹蛙转录组序列中发现微卫星位点3165个,包含于3034条Contig序列中。在筛选到的1~6碱基重复核心的微卫星中,单碱基重复核心的比例最高,之后为三碱基、二碱基、四碱基、六碱基和五碱基重复核心,分别占29.0%、25.2%、21.7%、10.0%、10.0%和3.0%。其中A/T、AC/GT、AGG/CCT、ACAT/ATCT、AAAAT/ATTTT和AAAAAG/CTTTTT分别是单碱基、二碱基、三碱基、四碱基、五碱基、六碱基重复类型中对应的优势重复单元。棘腹蛙编码区微卫星多为重复长度小于24 bp的短序列,长度大于24 bp的微卫星仅占总数的0.92%。对编码区微卫星的侧翼序列分析发现,微卫星侧翼序列的GC含量显著低于转录组整体GC含量,且在含有微卫星上下游侧翼序列的Contig中,71.9%的序列可以设计特异引物扩增出含有微卫星序列的位点。研究结果为棘腹蛙的遗传研究和分子系统地理学研究提供了丰富的序列信息和标记资源。
棘复蛙肌肉营养成份与能量含量
李鹄鸣,李文健,龚兴国,麻明友
Zoological Research 1993年第1期
DOI:
关键词: 棘腹蛙;;营养成份;;能量含量
摘要: 我们在棘腹蛙能流模型及人工繁殖技术研究中,对其营养成份及含肉率进行了初步研究。 材料 棘腹蛙幼娃和成蛙,均来自湘西的溪流中。 方法 1.将12只活蛙擦干称重后处死,除去皮肤与内脏,然后分成头、躯干、前肢和后肢等部分,并除去非肌肉质后称重,得各部分的肌肉含量。2.用索氏提取法测定脂肪含量,用微量凯氏定氮法测定蛋白质含量。3.用日立835—50型氨基酸分析仪测定肌肉蛋白质的各种氨基酸含量。4.用GR3500-B1微电脑热量计测定肌肉的能量含量。
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