摘要: 采用扫描取样和焦点动物取样法对四川马尔康林麝繁育场的45头圈养林麝进行行为取样,以其非静息行为的发生率作为活跃性指标,以社会亲和行为的发生强度作为社会亲和度指标,分析圈养林麝活跃性与其性别、圈群密度及社会亲和度的关系。结果表明:圈群密度和社会亲和度对圈养林麝的活跃性有显著影响(P<0.05),但活跃性雌雄差异不显著(P> 0.05)。与高密度圈群的林麝(0.25±0.021,n=32)相比,低密度圈群中的个体更活跃(0.40±0.022,n=4);活跃性与社会亲和度之间显著相关(r=0.390,P=0.01),活跃性较高个体倾向于展现高的社会亲和度。建议麝场在进行麝群构建时,充分考虑林麝个体的活跃性差异及与圈群密度的关系,以提高圈群稳定性和驯养生产力。

摘要: 本研究旨在解析林麝未成年组(n=10)和成年组(n=10)之间的菌群差异。收集林麝新鲜粪便,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V3-V4区,使用Illumina Miseq 300PE测序平台对扩增产物进行Miseq双端测序,通过计算ACE和Shannon等多样性指数,以及微生物组成成分和距离聚类分析,揭示组成结构与差异。α多样性分析表明成年组微生物的多样性丰富度略高于未成年组,但不存在显著差异性(P>0.05)。未成年组和成年组均是厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)所占的比例较高。成年组Proteobacteria比例明显高,而Firmicutes比例较低。LEfSe分析表明有12个显著差异的细菌分类。两组在Firmicutes门存在显著差异的细菌较少,而在Proteobacteria上存在显著差异的细菌较多。本研究证明在不同年龄阶段,微生物的丰富度和多样性不存在显著差异,细菌的组成成分也相同。但是在组成比例上存在差异性,间接反映了不同年龄阶段营养吸收的不同需求。

摘要: 林麝(Moschus berezovskii)是药用经济动物，其雄麝分泌的麝香是中成药和香水的重要成分，具有极高的药用价值和经济价值。miRNAs在动物细胞发育、分化、凋亡及疾病发生发展过程中起着至关重要的作用，并且在不同组织中miRNAs选择性表达。本研究利用RNA-seq技术在Hi-seq 2500测序平台对林麝的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉组织进行高通量测序，运用生物统计学和生物信息学方法分析这6种器官和组织中miRNAs的表达情况，采用RT-qPCR对测序结果进行验证。结果表明，林麝的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉组织中共表达的miRNAs有1 650个，特异表达的miRNAs分别有86个、54个、44个、68个、83个和50个(P <0.01)，共表达的miRNAs在不同器官和组织中表达水平存在显著差异(P <0.05)，林麝心脏中部分特异miRNAs的表达水平远远高于其他5种器官和组织中特异miRNAs的表达水平。KEGG分析表明：林麝肝脏特异表达miRNA靶基因主要涉及Wnt信号通路(ko04310)、cAMP信号通路(ko04024)、ECM受体相互作用(ko04512)、Notch信号途径(ko04330)、AMPK信号通路(ko04152)等(P <0.01)。随机选择9个miRNAs，利用RT-qPCR验证其在健康和化脓性林麝肝脏中的表达情况，结果表明其中9个miRNAs的表达趋势与测序结果一致。

摘要: 肠道疾病是养殖林麝(Moschus berezovskii)常见疾病。动物肠道微生物伴随宿主进化并与胃肠道构成了复杂的微生态系统。为探究不同饲养环境对圈养林麝肠道微生物组成和功能的影响，本研究对采自国内5个不同养殖场的215份粪便样品进行了16S rRNA基因高通量测序，对比分析不同养殖场林麝肠道微生物组成、多样性和功能的差异。结果显示，厚壁菌门和拟杆菌门是未喂食复合益生菌的祁连县养殖场林麝肠道菌群的绝对优势菌门，而喂食复合益生菌的甘肃两当县和陕西凤县的4家养殖场林麝肠道菌群的绝对优势菌门为厚壁菌门和变形菌门。不同养殖场林麝肠道菌群组成、优势菌门、优势菌属、潜在致病菌、代谢及疾病相关功能均有显著差异。祁连县养殖场林麝肠道微生物的α多样性和疾病相关功能表达量显著低于其他养殖场，并以肠型2为主，其主导菌为厚壁菌门、UCG-005和拟杆菌属；两当县和凤县的4家养殖场林麝肠道菌群潜在致病菌相对丰度较低。本研究推测食物组成差异可能是导致不同养殖场林麝肠道微生物差异的主要因素，复合益生菌的使用可能是导致α多样性和潜在致病菌下降的重要因素。该结果可为林麝的人工养殖和有效管理提供科学依据，也对人工饲养环境评估和未来的再引入计划具有一定指导意义。

摘要: 麝科和鹿科动物均属于偶蹄反刍类动物，具有重要的经济价值。通过系统的微卫星序列(Simple sequences repeats, SSRs)从基因组水平揭示物种间的系统进化关系，探索微卫星序列的基因功能及其富集的信号通路，目前仍缺乏相关研究。随着林麝(Moschus berezovskii)、原麝(Moschus moschiferus)、小麂(Muntiacus reevesi)、赤麂(Muntiacus vaginalis)和马鹿(Cervus elaphus)基因组测序的完成，本文利用生物信息学方法提取了这些动物蛋白质编码区(coding sequences, CDS)序列，统计和分析了其CDS区微卫星序列分布规律及其生物学功能，探索了含SSR基因富集的信号通路及其与疾病的关联性。结果表明，林麝、原麝、小麂、赤麂和马鹿蛋白质编码区含SSR序列的基因所占比例分别为6.96%(1 696个)、7.18%(2 359个)、7.29%(3 005个)、7.36%(1 916个)和7.48%(1 924个)，并且这5种动物CDS区SSRs分布模式具有相似性，均是三倍体核苷酸(即三核苷酸和六核苷酸) SSRs最多，分别为96.85%、94.87%、65.44%、64.23%和88.04%。GO功能富集表明，林麝与其他4种动物蛋白质编码区SSR序列在分子功能、细胞组成和生物学过程3个方面具有较多共同显著富集的功能，包括DNA结合、染色质和生长发育等。KEGG通路分析表明，林麝及其他4种动物蛋白质编码区SSR序列具有7个共同显著富集的KEGG通路，包括遗传信息调控蛋白家族、转录因子、染色体及相关蛋白、剪接体、转录机制和Notch信号通路和成体糖尿病。通过对林麝编码区含SSR关键免疫基因及其相关联的KEGG通路进行分析，发现10个含SSR的关键免疫基因对应的KEGG通路与疾病密切相关。