摘要: 本研究对2018至2021年采集的9号巢鼠（Micromys minutus）标本、22号红耳巢鼠（M. erythrotis）标本和19号待厘定的巢鼠属标本，进行形态分类和分子系统学分析，进一步揭示我国巢鼠属的分类和系统分化问题。待厘定的巢鼠属标本形态特征为：标本体背毛黑棕，体腹毛基灰色，毛尖灰白，体侧毛色具明显区分，尾背部毛色黑棕，尾腹部毛色灰棕色；尾长长于头体长的120%；头骨背面观可见颧弓明显弯曲；颅全长[（18.59±0.48）mm]和颅基长[（17.43±0.48 mm）]较长，腭长[（9.35±0.11）mm]较长，脑颅高[（7.43±0.06）mm]较高。待厘定的巢鼠属标本形态特征与巢鼠和红耳巢鼠均存在差异。待厘定巢鼠属标本与巢鼠和红耳巢鼠之间的遗传距离分别为0.115和0.136，接近于巢鼠与红耳巢鼠之间的遗传距离（0.126）。利用Cytb基因全序列和核基因IRBP1、RAG1和RAG2序列分别构建的巢鼠属系统发生树均以较高的置信度分化成3个进化支，即巢鼠、红耳巢鼠和待厘定的巢鼠属样本的进化支。形态学和分子系统学分析结果均支持待厘定的巢鼠属标本为独立物种分类单元，对应于文献记载的巢鼠川西亚种（M. m. pygmaeus）。根据产地、遗传距离和形态分化，建议将巢鼠川西亚种提升为种，命名为川西巢鼠（M. pygmaeus comb. nov.）。利用Cyt b基因全序列构建的巢鼠系统发生树分化成6个进化谱系：日韩谱系、欧洲谱系、俄罗斯新西伯利亚谱系、中国东北和俄罗斯远东谱系、中国安徽谱系和中国台湾谱系。

摘要: 巢鼠属Micromys的巢鼠M. minutus、红耳巢鼠M. erythrotis和高原巢鼠M. pygmaeus随着近年捕获样本的增多及系统发育研究的深入才被分类厘定，属内物种在我国一些地区的存在与否及分布地点等信息不明确。本研究在贵州省4个县（市）捕获到9只巢鼠属动物，通过cyt b基因序列比对确定为巢鼠和红耳巢鼠，测量其外形、毛色和头骨指标并进行对比；同时，从GenBank下载了全国82只巢鼠、红耳巢鼠和高原巢鼠cyt b基因序列进行对比，并综合这些鼠的采集点信息归纳3种鼠在贵州省的分布地点。结果显示，捕获的9只鼠包含5只巢鼠和4只红耳巢鼠，分别聚类于91只巢鼠属动物系统发育树3个支系中的2个。巢鼠的体长和尾长显著长于红耳巢鼠。从分布地点看，巢鼠、红耳巢鼠和高原巢鼠在贵州省的采集点分布表现为自东向西、由低海拔向高海拔变化，一些地区存在2种巢鼠同域分布的情况。研究结果填补了贵州省巢鼠属3个种的分化特征和分布地点空白。

摘要: 为了分析巢鼠属（Micromys）动物线粒体基因组结构及特征，以及通过线粒体基因组分析其系统发育关系，本研究对巢鼠（M. minutus）、红耳巢鼠（M. erythrotis）和川西巢鼠（M. pygmaeus）进行了线粒体基因组测序，并对其线粒体基因组结构、碱基组成、密码子使用情况以及tRNA二级结构进行分析，基于13个蛋白质编码基因串联序列构建最大似然系统发生树和贝叶斯系统发生树。本研究测序的巢鼠、红耳巢鼠和川西巢鼠线粒体基因组全序列长度分别为16 239 bp、16 240 bp和16 239 bp，其结构都包含22个tRNA编码基因、13个蛋白质编码基因、2个r RNA编码基因、1个L链复制起点（O_L）以及1个控制区（D-loop）。密码子使用情况，巢鼠和川西巢鼠差异较小，红耳巢鼠与另外两种巢鼠的差异相对较大。3种巢鼠的20种tRNA可形成三叶草型二级结构，trnK和trnS1由于缺少D环和二氢尿嘧啶臂无法折叠为三叶草结构，tRNA二级结构中出现的错配均为U-G错配。线粒体基因组各部分的遗传距离显示，巢鼠与川西巢鼠的遗传距离较小，系统发生树也显示巢鼠和川西巢鼠在一个分支，有较近的系统发育关系。3种巢鼠的线粒体基因结构及特征符合脊椎动物的线粒体基因组结构特征。