摘要: 鸟类是一些疾病的宿主及传播媒介，近年来，候鸟与家禽之间的疾病传播规律已成为研究热点。本研究采用16S rRNA高通量测序技术，对来自安徽省升金湖越冬小白额雁Anser erythropus与同域家鸭Anas platyrhynchos domesticus（各15份）的粪便样品进行了分析，将有效序列基于97%相似度归类为5 879个细菌分类操作单元，小白额雁4 919个，家鸭4 359个，共享3 378个。Alpha多样性（除Chao1指数外）和Beta多样性分析结果表明，小白额雁和同域家鸭的肠道菌群群落组成无显著性差异，优势菌群均为厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、变形菌门Proteobacteria和放线菌门Actinobacteria。PICRUSt分析发现，越冬小白额雁和同域家鸭的主要功能谱是代谢和遗传信息表达与传递。在小白额雁和同域家鸭的肠道中共检测到6种潜在病原体，在一定程度上影响宿主的健康，并具有传染给其他动物甚至人类的潜在风险。本研究初步揭示了升金湖越冬小白额雁和同域家鸭的肠道菌群的组成及结构特征，为潜在人禽共患病病原体的公共卫生风险防控提供了基础数据，具有重要的流行病学和公共卫生意义。