摘要: 脊椎动物基因组含有丰富的微卫星信息。本研究对翼手目动物中的大蹄蝠全基因组及其基因的微卫星分布特征进行分析，并对含有微卫星编码序列的基因进行注释分析。结果表明，大蹄蝠全基因组大小为2.24 Gb，共含有497 883个微卫星，其中，数量和比例最多的是单碱基和二碱基重复类型，分别有173 953个(34.94%)和222 591个(44.71%)，相对丰度分别为77.78 loci/Mb和99.52 loci/Mb。微卫星数量从单碱基重复到六碱基重复单元最多的类型分别为(A)n、(AC)n、(TAT)n、(TTTA)n、(AACAA)n和(TATCTA)n，比例分别为95.14%、55.25%、38.41%、22.17%、48.68%和20.30%。不同基因区和基因间区的数量及丰度不同，其中基因间区的微卫星数量及其丰度最大，分别为322 666个和2 541.57 loci/Mb，编码区的微卫星数量及其丰度最小，分别为1 461个和461.98 loci/Mb。基因间区和全基因组的微卫星的分布特征相似。编码区最多的微卫星类型为三碱基重复单元，外显子最多的微卫星类型为单碱基、二碱基和三碱基重复单元。在微卫星丰度分布的位置特征分析中，基因上游500 bp、外显子、内含子和基因下游500 bp各个区域微卫星丰度分别为16 400.94 loci/Mb、972.12 loci/Mb、2 180.66 loci/Mb和3 899.89 loci/Mb。大蹄蝠基因中含有微卫星的编码序列(Coding sequence, CDS) 1 461条，被注释到的基因有1 226个。GO注释到63个主要功能基因中，并分配到26 439个GO条目。KEGG富集最显著的是信号传导通路，含有146个基因。本研究结果不仅为大蹄蝠高质量微卫星的筛选提供参考，还将进一步为翼手目其他物种的全基因组微卫星分布特征分析及其微卫星在全基因组中的生物学功能研究提供参考。

摘要: 本研究组于2016年8月在西藏自治区墨脱县达木乡贡日村及背崩乡背崩村使用手抄网及雾网分别采集到一批蝙蝠，其中8只蝙蝠（2♂、6♀）体型较大，马蹄形鼻叶特征明显，保留1只雌性标本（标本号162427），结合传统形态和分子系统发育方法对其进行物种鉴定。该标本体型大，头体长为78.7 mm，前臂长为92.5 mm，毛长而细密，通体呈深棕色，毛基部淡棕白，逐渐过渡到棕褐色；腹毛色调浅，毛基部灰色，毛尖过渡到灰白色。后足长（17.2mm）不及胫骨长（39.8mm）的一半；前鼻叶中间无缺刻，两侧各有4片小附叶；耳大而尖，其后缘内凹。脑颅较平，颅全长31.9 mm，颅高13.3 mm，头骨吻突自前至后明显升高，与矢状脊相接；颧弓宽，有高隆的颧弓板。以上特征与大蹄蝠（Hipposideros armiger）的外形及头骨特征相符。头体长、耳长及尾长的数据略小于中国云南、四川以及越南的标本，但头骨数据基本相近。同时，基于Cyt b和COI基因序列的系统发育分析表明，此次捕获的蹄蝠标本与大蹄蝠聚类在一起。结合形态与分子数据，确定该物种为大蹄蝠，为西藏自治区翼手目分布新记录种。标本保存于广东省科学院动物研究所。

摘要: 大蹄蝠(Hipposideros armiger)隶属于翼手目蹄蝠科，目前划分指名亚种(H. a. armiger)、福建亚种(H. a. fujianensis)、台湾亚种(H. a. terasensis)和越南亚种(H. a. traninhensis) 4个亚种，其中前3个亚种在我国广东、云南等16个省区广泛分布，但也有学者对其亚种的有效性存在争议。为进一步明确大蹄蝠的亚种分类状况，本研究以中国区域内最接近模式产地(尼泊尔)的西藏样本为切入点，结合历年采集于各省区的形态学数据和分子序列，对大蹄蝠的亚种分类进行探讨。结果显示，该种外形、头骨特征及测量数据均未发现指名亚种、福建亚种和台湾亚种间存在明显差异；系统发育树提示福建、台湾在内的多地大蹄蝠序列聚为高支持度的一支，未见明显分化，3个亚种间遗传距离仅0.002～0.013；单倍型网络图亦未发现各亚种间存在明显的种群遗传结构与地理差异。基于上述证据，本研究认为中国区域内的大蹄蝠应归为同一亚种——大蹄蝠指名亚种(H. a. armiger)，该结果不仅有助于进一步明确国内大蹄蝠的亚种分类地位，也为深入理解该种的演化历史提供了基础资料。