摘要: 探究土壤食细菌线虫取食偏好的分子机制是揭示其如何发挥生态学功能的关键，而明确取食相关基因的序列和结构对于探究其取食偏好的分子机制至关重要.采用RT-PCR和RACE方法从两种土著线虫（中杆属线虫Mesorhabditis sp. NJ和拟丽突属线虫Acrobeloides sp. NJ）中各克隆到5条取食相关基因的全长cDNA序列，分别命名为Msp-egl-4、Msp-gcy-28、Msp-odr-3、Msp-tax-2、Msp-tax-4和Asp-egl-4、Asp-gcy-28、Asp-odr-3、Asp-tax-2、Asp-tax-4.应用生物信息学方法对这10条基因进行序列及理化特性分析，并对其编码蛋白的保守结构域、跨膜结构域、二级结构、三级结构等进行预测.结果显示10条基因全长912-3 699 bp不等，分别编码304-1 233个氨基酸.将氨基酸序列与秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans比对发现，线虫两两之间相同功能基因的相似性比例在50%以上.这10个基因都具有特定的保守结构域及重要功能位点，编码蛋白的二级结构以α-螺旋为主.三级结构预测表明：两种土著线虫中，EGL-4、TAX-2和TAX-4分别由同一模版预测得到，说明其序列结构的保守性，GCY-28和ODR-3分别由不同的模版预测得到，暗示其序列结构在进化过程中出现了分化.本研究结果获得了两种土著食细菌线虫取食偏好相关基因的序列和结构，并预测了相关保守的结构域和功能位点，可为后续探究食细菌线虫取食相关基因的生物学功能和取食偏好的分子机制提供理论基础.（图3表3参41）