摘要: 为探讨青藏高原喜马拉雅旱獭适应高原低氧机理,分析其血液生理特征和心肺组织学改变。选择连续海拔段的青海省乌兰县(海拔3 200—3 400 m)、囊谦县(3 600—3 800m)、兴海县(3 800—4 000 m)和泽库县(4 000—4 200 m)作为现场采样点,采用圈套法捕获喜马拉雅旱獭样本,记录标本采集信息和生境类型,静脉注射5%戊巴比妥钠麻醉旱獭后,心脏采血3—5 m L并置于抗凝管中。处死旱獭后迅速摘取心脏和肺脏,并将样本放入4%甲醛溶液中。利用全自动血液分析仪测定红细胞(RBC)、血红蛋白(HGB)、血细胞比容(HCT)、平均红细胞体积(MCV)和血小板(PLT)等生理指标。固定后的心肺样本按常规方法切片(厚4μm),HE染色后光镜观察。结果发现乌兰县喜马拉雅旱獭的HBC、HGB、HCT最高,而囊谦县旱獭的RBC、HGB、HCT数值最低。MCV随海拔的升高而降低,而PLT则相反,随海拔的升高而增加。显微镜下观察喜马拉雅旱獭心肺组织的HE染色切片,4个地区的心肺切片中均有不同程度的损伤。说明该动物对高原低氧环境有一定的生理适应性。

摘要: 为探究低、中、高3个不同海拔梯度下喜马拉雅旱獭（Marmota himalayana）基因表达是否存在差异，筛选该物种与高原低氧及强紫外辐射环境适应的相关候选基因，采用Illumina HiSeq 2500高通量测序平台对喜马拉雅旱獭肝脏组织进行无参转录组学分析，通过对质控后测序数据与参考基因组的比较分析，筛选差异表达基因后进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果显示：乐都样品（低海拔组，LD）、玉树样品（高海拔组，YS）喜马拉雅旱獭肝脏组织中差异表达基因差异较大，刚察样品（中海拔组，GC）与其他两组间均具有较小的基因表达差异模式。上调表达基因在19个GO Terms和6个KEGG通路上有显著富集，氧化磷酸化相关基因（HiF-1α、MPKA3）、矿物质吸收及脂质代谢相关基因（PPARs）在高海拔组中呈现上调表达，推测这些基因可能直接或间接在喜马拉雅旱獭适应高海拔低氧等极端环境中，通过调整细胞代谢、提高氧化还原能力以及增强免疫反应来维持自身的生理功能和生存能力，为后续深入研究高原野生动物基因多样性以及喜马拉雅旱獭低氧适应性提供基因组学数据。

摘要: 为揭示喜马拉雅旱獭（Marmota himalayana）的遗传进化机制,基于双酶切RAD（dd-RAD）测序技术,对青海省3个地区（乐都、玉树、黄南）44例喜马拉雅旱獭简化基因组测序分析,通过SNP位点刻画其遗传特性,构建系统进化树,分析种群结构特征,从基因水平分析不同地区个体之间的遗传进化关系。结果显示:3个地区喜马拉雅旱獭共获得19 279 845个SNP位点,具有丰富的遗传多样性,各地区喜马拉雅旱獭的观测杂合度（H_o）为0.236～0.269,期望杂合度（He）为0.232～0.254。3个地区中,乐都和玉树的喜马拉雅旱獭杂合过度（He>He）,黄南地区的多态信息量最大、有效等位基因数更接近等位基因数,表明其基因纯化程度和多态性高、等位基因分布较均匀;系统发育树将黄南样品分为2个遗传分支,乐都和玉树聚为1支。研究结果可为研究喜马拉雅旱獭比较基因组学和旱獭属动物的资源合理利用提供参考依据。

摘要: 以分布在不同海拔(2 279、3 273、4 452 m)的喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)为供试材料，通过二代测序技术对线粒体基因组序列进行比较分析，挖掘喜马拉雅旱獭低氧适应相关基因。结果表明:不同海拔喜马拉雅旱獭线粒体序列长度之间并无差异，但蛋白质编码基因突变位点个数随海拔增加而增多，ND5基因的突变位点个数和非同义突变位点个数都为最多，其Ka/Ks> 1，表明ND5基因存在正选择效应，可作为适应高海拔低氧环境的候选基因。与玉树(海拔4 452 m)相比，乐都(海拔2 279 m)和黄南(海拔3 273 m)的喜马拉雅旱獭亲缘关系相对较近。喜马拉雅旱獭13个蛋白质编码基因的核苷酸序列共编码氨基酸3 812个，去掉起始密码子和终止密码子后共编码氨基酸3 802个。在20种氨基酸中，Leu的使用率最高，达16.18%,Gys的使用率最低，仅有0.71%。RSCU值> 1的密码子有32种，RSCU值<1的密码子有32种，其中AGG的RSCU为0。

摘要: 目的 为了探讨我国青藏高原喜马拉雅旱獭是否可以作为核苷类药物线粒体毒性评价替代模型，本研究从旱獭的系统进化关系对喜马拉雅旱獭在旱獭属中的系统分类地位进行了比较分析。方法 以线粒体细胞色素b(Cytb)基因作为遗传进化分析的分子标记，对我国青藏高原喜马拉雅旱獭的Cytb进行了序列测定,并结合已有的旱獭Cytb基因序列对所有旱獭属的种群进行了系统进化分析。结果 喜马拉雅旱獭Cytb基因长1 140 bp,碱基A、T、C、G的平均含量分别为33.2%、25.4%、28.8%、12.6%。Cytb基因表现出很强的碱基组成偏向性，即在A、T、G、C四种碱基中，G的含量明显低于其他三种碱基的含量。旱獭的Cytb基因的氨基酸使用频率具有一定的偏向性，亮氨酸(Leu)和异亮氨酸(Ile)的使用频率最高，分别为15.69%和11.87%，而半胱氨酸(Cys)使用频率最低为1.08%。与其它旱獭相比，喜马拉雅异亮氨酸(Ile)和半胱氨酸(Cys)的使用频率分别为1.32%和11.87%。系统进化分析结果表明我国喜马拉雅旱獭(M.himalyana)、蒙古旱獭(M.sibirica)、灰旱獭(M.caudata)和红旱獭(M.bobak)与北美旱獭(Woodchuck)属于同一进化组群(置信度为100)。结论 喜马拉雅旱獭与美洲旱獭具有较近的亲缘进化关系，属同一组群进化而来，这为寻找新型的核苷类药物线粒体毒性评价替代实验动物模型提供了理论依据。